RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464495.4

SOGA3-204, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SOGA3, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-204ENST00000464495 ROBO2Q9HCK4 1378 aa14.92□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 PXDNQ92626 1479 aa14.92□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 FOXO3O43524 673 aa14.91□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 HRCP23327 699 aa14.91□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.91□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 SLIT2O94813 1529 aa14.91□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.9□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 A0A0G2JS52 829 aa14.9□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 MYT1Q01538 1121 aa14.9□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 KIF12Q96FN5 646 aa14.9□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.9□□□□□ -0.02
SOGA3-204ENST00000464495 PLEKHG5O94827 1062 aa14.89□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 POTEJP0CG39 1038 aa14.88□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 VPS72Q15906 364 aa14.88□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.88□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 USP32Q8NFA0 1604 aa14.87□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 CLTCL1P53675 1640 aa14.86□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.86□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 MIER1Q8N108 512 aa14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.85□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 KIF1AQ12756 1690 aa14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 POTEMA6NI47 508 aa14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 YY1P25490 414 aa14.84□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.83□□□□□ -0.03
SOGA3-204ENST00000464495 PSME1Q06323 249 aa14.83□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 NAIPQ13075 1403 aa14.82□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 NUTM2FA1L443 756 aa14.81□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 ITGAEP38570 1179 aa14.81□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.81□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 RASEFQ8IZ41 740 aa14.8□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 POTEGQ6S5H5 508 aa14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 TRPC6Q9Y210 931 aa14.79□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 ARHGEF10O15013 1369 aa14.78□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 MAP3K13O43283 966 aa14.78□□□□□ -0.04
SOGA3-204ENST00000464495 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 PPLO60437 1756 aa14.77□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 ADGRB2O60241 1585 aa14.77□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.76□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 STK26Q9P289 416 aa14.76□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 DISP2A7MBM2 1401 aa14.75□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.75□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.75□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 SBNO1A3KN83 1393 aa14.74□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 TIE1P35590 1138 aa14.74□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.74□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.74□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.74□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 TECPR2O15040 1411 aa14.74□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.73□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 POTEFA5A3E0 1075 aa14.73□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 BTG4Q9NY30 223 aa14.73□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 ABCA3Q99758 1704 aa14.72□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 FAM83GA6ND36 823 aa14.72□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.72□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 NBPF14Q5TI25 921 aa14.72□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.71□□□□□ -0.05
SOGA3-204ENST00000464495 ABCC11Q96J66 1382 aa14.71□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 NRAPQ86VF7 1730 aa14.7□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.7□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 IFT172Q9UG01 1749 aa14.69□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 APBA3O96018 575 aa14.68□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 FAM182BQ5T319 152 aa14.68□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.68□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.68□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.67□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.67□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.67□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 SPON1Q9HCB6 807 aa14.67□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.67□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.66□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.66□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 TRIM37O94972 964 aa14.66□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 SIRT1Q96EB6 747 aa14.66□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.65□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.65□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.65□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.65□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.65□□□□□ -0.06
SOGA3-204ENST00000464495 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.63□□□□□ -0.07
SOGA3-204ENST00000464495 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms