RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 AKAP12Q02952 1782 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 NSD2O96028 1365 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 SBNO1A3KN83 1393 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 FYB1O15117 783 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 RALBP1Q15311 655 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 ABTB2Q8N961 1025 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 COG3Q96JB2 828 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa12.77□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 MORC1Q86VD1 984 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 NME9Q86XW9 330 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 PXDNQ92626 1479 aa12.77□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 NLRP6P59044 892 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 NLRP13Q86W25 1043 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF10O15013 1369 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 USP31Q70CQ4 1352 aa12.76□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 NRKQ7Z2Y5 1582 aa12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 PARD3Q8TEW0 1356 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 NUTM2GQ5VZR2 741 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 OVOS2Q6IE36 1432 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.71□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 USP19O94966 1318 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 PIK3C2AO00443 1686 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 PHLPP1O60346 1717 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 GCP02774 474 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP2R1AP30153 589 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 ALS2Q96Q42 1657 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 MIER1Q8N108 512 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO41Q8TF61 875 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 USP54Q70EL1 1684 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 CCER2I3L3R5 266 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 SOX12O15370 315 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHG5O94827 1062 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPA1LP34931 641 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 POLKQ9UBT6 870 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 JCADQ9P266 1359 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 MTHFSP49914 203 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP53Q96M91 514 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 SLIT3O75094 1523 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 AMPHP49418 695 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 FBLN1P23142 703 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 CPDO75976 1380 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 MRS2Q9HD23 443 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 NFAT5O94916 1531 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 RTL1A6NKG5 1358 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 IP6K1Q92551 441 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 INSRP06213 1382 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 FLT4P35916 1363 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0232Q92628 1395 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 SHPRHQ149N8 1683 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXC9P31274 260 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDCQ9Y266 331 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.57□□□□□ -0.4
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