RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PSME1Q06323 249 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 C8orf37Q96NL8 207 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 CARD11Q9BXL7 1154 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 ACEP12821 1306 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 AFF2P51816 1311 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 SBNO1A3KN83 1393 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP12Q02952 1782 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 SOCS7O14512 581 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 CABP1Q9NZU7 370 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.99□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 NGLY1Q96IV0 654 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 TESK2Q96S53 571 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 EVC2Q86UK5 1308 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM83GA6ND36 823 aa9.96□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 USP21Q9UK80 565 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ATRNO75882 1429 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 SSH2Q76I76 1423 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 SLIT2O94813 1529 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 PIK3C2AO00443 1686 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 NRAPQ86VF7 1730 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.95□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 RGPD5Q99666 1765 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF10O15013 1369 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 RXRBP28702 533 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 POLA2Q14181 598 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 GLI3P10071 1580 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 USP6P35125 1406 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 USP47Q96K76 1375 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 CHRNA2Q15822 529 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ABTB2Q8N961 1025 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS12O14924 1447 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 COL18A1P39060 1754 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 UNC5CLQ8IV45 518 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 USP19O94966 1318 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA0232Q92628 1395 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 TMC1Q8TDI8 760 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 BTG4Q9NY30 223 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 MYOM1P52179 1685 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 SLIT3O75094 1523 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 GCP02774 474 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRP6P59044 892 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PP64 1363 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 USP54Q70EL1 1684 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 EP400Q96L91 3159 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS72Q15906 364 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 NLRP13Q86W25 1043 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 NME9Q86XW9 330 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms