RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 ADAMTS2O95450 1211 aa25.72■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.71■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHG5O94827 1062 aa25.71■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
DDR1-241ENST00000460944 ABCA3Q99758 1704 aa25.7■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 C8orf37Q96NL8 207 aa25.69■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.68■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 ILDR2Q71H61 639 aa25.67■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.67■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.67■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.67■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 ABTB2Q8N961 1025 aa25.66■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 NGLY1Q96IV0 654 aa25.65■■□□□ 1.7
DDR1-241ENST00000460944 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.63■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.63■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.63■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.63■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 SSH2Q76I76 1423 aa25.63■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 AFF2P51816 1311 aa25.63■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.62■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 A0A1W2PP64 1363 aa25.61■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 NLRP13Q86W25 1043 aa25.61■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.61■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 PIK3C2AO00443 1686 aa25.58■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
DDR1-241ENST00000460944 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.57■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 NLRP6P59044 892 aa25.57■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.57■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 MYOM1P52179 1685 aa25.56■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 USP19O94966 1318 aa25.56■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 POTEAQ6S8J7 498 aa25.54■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 USP21Q9UK80 565 aa25.54■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.53■■□□□ 1.68
DDR1-241ENST00000460944 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.51■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.51■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 SLIT3O75094 1523 aa25.5■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 SLIT2O94813 1529 aa25.5■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 KIAA0232Q92628 1395 aa25.49■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 GCP02774 474 aa25.49■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 FAM83GA6ND36 823 aa25.48■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 SOCS7O14512 581 aa25.48■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 NME9Q86XW9 330 aa25.48■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 USP54Q70EL1 1684 aa25.48■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 USP31Q70CQ4 1352 aa25.47■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.47■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.47■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.46■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 CPDO75976 1380 aa25.45■■□□□ 1.67
DDR1-241ENST00000460944 RXRBP28702 533 aa25.44■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 ATRNO75882 1429 aa25.44■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 BTG4Q9NY30 223 aa25.43■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.43■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 SOX12O15370 315 aa25.42■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 CHRNA2Q15822 529 aa25.42■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.42■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.42■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 NRAPQ86VF7 1730 aa25.41■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.41■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.41■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.41■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.4■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 COG3Q96JB2 828 aa25.4■■□□□ 1.66
DDR1-241ENST00000460944 NFAT5O94916 1531 aa25.38■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.37■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.36■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 VPS72Q15906 364 aa25.36■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.35■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.35■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 FYB1O15117 783 aa25.34■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.34■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.34■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 PANK3Q9H999 370 aa25.34■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 STRN4Q9NRL3 753 aa25.34■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 LTN1O94822 1766 aa25.33■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 CCDC7Q96M83 1385 aa25.33■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.33■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 EVA1CP58658 441 aa25.33■■□□□ 1.65
DDR1-241ENST00000460944 GLI3P10071 1580 aa25.31■■□□□ 1.64
DDR1-241ENST00000460944 COL18A1P39060 1754 aa25.31■■□□□ 1.64
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