RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARHGEF10O15013 1369 aa12.42□□□□□ -0.42
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GAPDHP28-201ENST00000455134 STAC3Q96MF2 364 aa12.41□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
GAPDHP28-201ENST00000455134 SBF2Q86WG5 1849 aa12.39□□□□□ -0.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSME1Q06323 249 aa12.39□□□□□ -0.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL18A1P39060 1754 aa12.38□□□□□ -0.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIK3C2AO00443 1686 aa12.38□□□□□ -0.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.37□□□□□ -0.43
GAPDHP28-201ENST00000455134 VPS72Q15906 364 aa12.37□□□□□ -0.43
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GAPDHP28-201ENST00000455134 CDK19Q9BWU1 502 aa12.33□□□□□ -0.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa12.33□□□□□ -0.44
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GAPDHP28-201ENST00000455134 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa12.3□□□□□ -0.44
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GAPDHP28-201ENST00000455134 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.29□□□□□ -0.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.29□□□□□ -0.44
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GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa12.29□□□□□ -0.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSH2Q76I76 1423 aa12.28□□□□□ -0.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
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GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.28□□□□□ -0.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.28□□□□□ -0.44
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP19O94966 1318 aa12.28□□□□□ -0.44
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
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GAPDHP28-201ENST00000455134 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa12.19□□□□□ -0.46
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GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCC6O95255 1503 aa12.18□□□□□ -0.46
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GAPDHP28-201ENST00000455134 NEUROD1Q13562 356 aa12.18□□□□□ -0.46
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GAPDHP28-201ENST00000455134 NLRP13Q86W25 1043 aa12.18□□□□□ -0.46
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
GAPDHP28-201ENST00000455134 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRB1P82279 1406 aa12.17□□□□□ -0.46
GAPDHP28-201ENST00000455134 CASZ1Q86V15 1759 aa12.17□□□□□ -0.46
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.16□□□□□ -0.46
GAPDHP28-201ENST00000455134 EVC2Q86UK5 1308 aa12.16□□□□□ -0.46
GAPDHP28-201ENST00000455134 BAG6P46379 1132 aa12.16□□□□□ -0.46
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GAPDHP28-201ENST00000455134 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.16□□□□□ -0.46
GAPDHP28-201ENST00000455134 NHSQ6T4R5 1651 aa12.16□□□□□ -0.46
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