RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SESN3P58005 492 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CTAGE5O15320 804 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 LMAN1P49257 510 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 PSMD2Q13200 908 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 KIF2CQ99661 725 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 RMI1Q9H9A7 625 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SH3BP5O60239 455 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 ERCC3P19447 782 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 WHAMMQ8TF30 809 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 HS1BP3Q53T59 392 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 RLBP1P12271 317 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 DDX12PQ92771 950 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CDCA8Q53HL2 280 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 19.8
PTPRC-209ENST00000442510 HOMER1Q86YM7 354 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SH3GL3Q99963 347 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 KIF5CO60282 957 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SLC20A2Q08357 652 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 FAM212AQ96EL1 285 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 VEZTQ9HBM0 779 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 DONSONQ9NYP3 566 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 RNF217Q8TC41 542 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-209ENST00000442510 SHTN1A0MZ66 631 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 TMTC2Q8N394 836 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CEP104O60308 925 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MCM6Q14566 821 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 E2F4Q16254 413 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CA8P35219 290 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 FOSBP53539 338 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SPC24Q8NBT2 197 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 STK26Q9P289 416 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 PEX19P40855 299 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM29Q14134 588 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 KIF3BO15066 747 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ABCD1P33897 745 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA2Q08379 1002 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CEP57Q86XR8 500 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MMP14P50281 582 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MCTP2Q6DN12 878 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CXorf38Q8TB03 319 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 CEP89Q96ST8 783 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 TRHP20396 242 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 KIF18AQ8NI77 898 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 FBXW7Q969H0 707 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 GUCY2CP25092 1073 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 TRAF1Q13077 416 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 FOXD1Q16676 465 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 LUZP1Q86V48 1076 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 KIF4AO95239 1232 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-209ENST00000442510 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms