RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439994.5

EML3-206, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 5

Gene EML3, Length 671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-206	ENST00000439994	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
EML3-206	ENST00000439994	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		33.79	■■■■□ 3
EML3-206	ENST00000439994	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
EML3-206	ENST00000439994	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		33.78	■■■■□ 3
EML3-206	ENST00000439994	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.76	■■■□□ 2.99
EML3-206	ENST00000439994	FAM83G	A6ND36	823 aa		33.74	■■■□□ 2.99
EML3-206	ENST00000439994	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.74	■■■□□ 2.99
EML3-206	ENST00000439994	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
EML3-206	ENST00000439994	NRAP	Q86VF7	1730 aa		33.72	■■■□□ 2.99
EML3-206	ENST00000439994	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
EML3-206	ENST00000439994	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
EML3-206	ENST00000439994	CDK19	Q9BWU1	502 aa		33.71	■■■□□ 2.99
EML3-206	ENST00000439994	LRP5	O75197	1615 aa		33.69	■■■□□ 2.98
EML3-206	ENST00000439994	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		33.69	■■■□□ 2.98
EML3-206	ENST00000439994	ALS2	Q96Q42	1657 aa		33.68	■■■□□ 2.98
EML3-206	ENST00000439994	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.68	■■■□□ 2.98
EML3-206	ENST00000439994	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		33.67	■■■□□ 2.98
EML3-206	ENST00000439994	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		33.67	■■■□□ 2.98
EML3-206	ENST00000439994	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
EML3-206	ENST00000439994	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		33.66	■■■□□ 2.98
EML3-206	ENST00000439994	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
EML3-206	ENST00000439994	BTG4	Q9NY30	223 aa		33.62	■■■□□ 2.97
EML3-206	ENST00000439994	BAG6	P46379	1132 aa		33.61	■■■□□ 2.97
EML3-206	ENST00000439994	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
EML3-206	ENST00000439994		A0A0G2JS52	829 aa		33.58	■■■□□ 2.97
EML3-206	ENST00000439994	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
EML3-206	ENST00000439994	MYT1	Q01538	1121 aa		33.58	■■■□□ 2.97
EML3-206	ENST00000439994	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		33.58	■■■□□ 2.97
EML3-206	ENST00000439994	ATP7B	P35670	1465 aa		33.57	■■■□□ 2.97
EML3-206	ENST00000439994	EVC2	Q86UK5	1308 aa		33.56	■■■□□ 2.96
EML3-206	ENST00000439994	CABP2	Q9NPB3	220 aa		33.56	■■■□□ 2.96
EML3-206	ENST00000439994	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.56	■■■□□ 2.96
EML3-206	ENST00000439994	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		33.55	■■■□□ 2.96
EML3-206	ENST00000439994	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		33.54	■■■□□ 2.96
EML3-206	ENST00000439994	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		33.54	■■■□□ 2.96
EML3-206	ENST00000439994	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		33.53	■■■□□ 2.96
EML3-206	ENST00000439994	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.52	■■■□□ 2.96
EML3-206	ENST00000439994	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		33.5	■■■□□ 2.95
EML3-206	ENST00000439994	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
EML3-206	ENST00000439994	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.49	■■■□□ 2.95
EML3-206	ENST00000439994	ITSN1	Q15811	1721 aa		33.49	■■■□□ 2.95
EML3-206	ENST00000439994	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		33.48	■■■□□ 2.95
EML3-206	ENST00000439994	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
EML3-206	ENST00000439994	USP47	Q96K76	1375 aa		33.46	■■■□□ 2.95
EML3-206	ENST00000439994	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
EML3-206	ENST00000439994	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		33.45	■■■□□ 2.95
EML3-206	ENST00000439994	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		33.45	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	TESK2	Q96S53	571 aa		33.44	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	ACE	P12821	1306 aa		33.43	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.42	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		33.42	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	CABP1	Q9NZU7	370 aa		33.41	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.4	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	SLC24A1	O60721	1099 aa		33.4	■■■□□ 2.94
EML3-206	ENST00000439994	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.93
EML3-206	ENST00000439994	KIAA0232	Q92628	1395 aa		33.38	■■■□□ 2.93
EML3-206	ENST00000439994	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
EML3-206	ENST00000439994	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
EML3-206	ENST00000439994	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.33	■■■□□ 2.93
EML3-206	ENST00000439994	CHRNA2	Q15822	529 aa		33.31	■■■□□ 2.92
EML3-206	ENST00000439994	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
EML3-206	ENST00000439994	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.31	■■■□□ 2.92
EML3-206	ENST00000439994	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.3	■■■□□ 2.92
EML3-206	ENST00000439994	TMF1	P82094	1093 aa		33.28	■■■□□ 2.92
EML3-206	ENST00000439994	STRN4	Q9NRL3	753 aa		33.28	■■■□□ 2.92
EML3-206	ENST00000439994	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
EML3-206	ENST00000439994	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.27	■■■□□ 2.92
EML3-206	ENST00000439994	TRIM37	O94972	964 aa		33.26	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	33.26	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	SSH2	Q76I76	1423 aa		33.26	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		33.23	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	TMC1	Q8TDI8	760 aa		33.23	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		33.22	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	CPD	O75976	1380 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	USP6	P35125	1406 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	RREB1	Q92766	1687 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	APBA3	O96018	575 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		33.21	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	EVA1C	P58658	441 aa		33.2	■■■□□ 2.91
EML3-206	ENST00000439994	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	USP19	O94966	1318 aa		33.19	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	CDCA8	Q53HL2	280 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	ABTB2	Q8N961	1025 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.16	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	AKAP12	Q02952	1782 aa		33.15	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.14	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		33.14	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
EML3-206	ENST00000439994	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9

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