RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, humanhuman

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG11-208ENST00000437028 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SNHG11-208ENST00000437028 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SNHG11-208ENST00000437028 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SNHG11-208ENST00000437028 NRAPQ86VF7 1730 aa22.34■■□□□ 1.17
SNHG11-208ENST00000437028 BTG4Q9NY30 223 aa22.34■■□□□ 1.17
SNHG11-208ENST00000437028 A0A0G2JS52 829 aa22.33■■□□□ 1.17
SNHG11-208ENST00000437028 MYT1Q01538 1121 aa22.33■■□□□ 1.17
SNHG11-208ENST00000437028 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.32■■□□□ 1.16
SNHG11-208ENST00000437028 CDK19Q9BWU1 502 aa22.32■■□□□ 1.16
SNHG11-208ENST00000437028 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.31■■□□□ 1.16
SNHG11-208ENST00000437028 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.3■■□□□ 1.16
SNHG11-208ENST00000437028 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.29■■□□□ 1.16
SNHG11-208ENST00000437028 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.29■■□□□ 1.16
SNHG11-208ENST00000437028 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SNHG11-208ENST00000437028 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SNHG11-208ENST00000437028 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SNHG11-208ENST00000437028 ACEP12821 1306 aa22.26■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.25■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.25■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.25■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 KIAA0232Q92628 1395 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 BAG6P46379 1132 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG11-208ENST00000437028 ABTB2Q8N961 1025 aa22.2■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 CHRNA2Q15822 529 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 STRN4Q9NRL3 753 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 EVA1CP58658 441 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 NLRP13Q86W25 1043 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.16■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 CABP2Q9NPB3 220 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 CPDO75976 1380 aa22.14■■□□□ 1.14
SNHG11-208ENST00000437028 USP19O94966 1318 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 SSH2Q76I76 1423 aa22.13■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 EVC2Q86UK5 1308 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.11■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 GCP02774 474 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 BARGINQ6ZT62 677 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 CABP1Q9NZU7 370 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 USP35Q9P2H5 1018 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.09■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 DISP2A7MBM2 1401 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 USP6P35125 1406 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 FAM182BQ5T319 152 aa22.08■■□□□ 1.13
SNHG11-208ENST00000437028 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 PDE3BQ13370 1112 aa22.07■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 NEUROD1Q13562 356 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.06■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 NLRP6P59044 892 aa22.05■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 LRP5O75197 1615 aa22.05■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 SLIT3O75094 1523 aa22.02■■□□□ 1.12
SNHG11-208ENST00000437028 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.01■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 TRIM37O94972 964 aa22.01■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 CRB1P82279 1406 aa22■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 PIK3C2AO00443 1686 aa21.99■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 APBA3O96018 575 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.98■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 AKAP12Q02952 1782 aa21.97■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.97■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.96■■□□□ 1.11
SNHG11-208ENST00000437028 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SNHG11-208ENST00000437028 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG11-208ENST00000437028 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.94■■□□□ 1.1
SNHG11-208ENST00000437028 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SNHG11-208ENST00000437028 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SNHG11-208ENST00000437028 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.92■■□□□ 1.1
SNHG11-208ENST00000437028 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.92■■□□□ 1.1
SNHG11-208ENST00000437028 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.92■■□□□ 1.1
SNHG11-208ENST00000437028 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.92■■□□□ 1.1
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