RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429374.5

HDAC10-204, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-204ENST00000429374 USP6P35125 1406 aa25.08■■□□□ 1.6
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HDAC10-204ENST00000429374 COG3Q96JB2 828 aa25.06■■□□□ 1.6
HDAC10-204ENST00000429374 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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HDAC10-204ENST00000429374 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.05■■□□□ 1.6
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HDAC10-204ENST00000429374 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.02■■□□□ 1.6
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HDAC10-204ENST00000429374 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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HDAC10-204ENST00000429374 RCAN3Q9UKA8 241 aa25■■□□□ 1.59
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HDAC10-204ENST00000429374 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.99■■□□□ 1.59
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HDAC10-204ENST00000429374 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
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HDAC10-204ENST00000429374 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.96■■□□□ 1.59
HDAC10-204ENST00000429374 NUTM2FA1L443 756 aa24.94■■□□□ 1.58
HDAC10-204ENST00000429374 WDR63Q8IWG1 891 aa24.94■■□□□ 1.58
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HDAC10-204ENST00000429374 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.94■■□□□ 1.58
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HDAC10-204ENST00000429374 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HDAC10-204ENST00000429374 IL16Q14005 1332 aa24.8■■□□□ 1.56
HDAC10-204ENST00000429374 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.8■■□□□ 1.56
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HDAC10-204ENST00000429374 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.79■■□□□ 1.56
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HDAC10-204ENST00000429374 NEUROD2Q15784 382 aa24.78■■□□□ 1.56
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HDAC10-204ENST00000429374 PEAK1Q9H792 1746 aa24.77■■□□□ 1.56
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HDAC10-204ENST00000429374 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.75■■□□□ 1.55
HDAC10-204ENST00000429374 FLT4P35916 1363 aa24.74■■□□□ 1.55
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HDAC10-204ENST00000429374 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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HDAC10-204ENST00000429374 RIPK4P57078 832 aa24.72■■□□□ 1.55
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HDAC10-204ENST00000429374 ABTB2Q8N961 1025 aa24.72■■□□□ 1.55
HDAC10-204ENST00000429374 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.72■■□□□ 1.55
HDAC10-204ENST00000429374 NFE2L2Q16236 605 aa24.72■■□□□ 1.55
HDAC10-204ENST00000429374 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HDAC10-204ENST00000429374 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.71■■□□□ 1.55
HDAC10-204ENST00000429374 PSME1Q06323 249 aa24.71■■□□□ 1.55
HDAC10-204ENST00000429374 STRCQ7RTU9 1775 aa24.7■■□□□ 1.55
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