RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 PHLPP1O60346 1717 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 PXDNQ92626 1479 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 SSH2Q76I76 1423 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 PIK3C2AO00443 1686 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 ALS2Q96Q42 1657 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXA4-202ENST00000428284 SBNO1A3KN83 1393 aa28.19■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.18■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 NME9Q86XW9 330 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 ABTB2Q8N961 1025 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 FYB1O15117 783 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXA4-202ENST00000428284 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
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HOXA4-202ENST00000428284 USP54Q70EL1 1684 aa28.14■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 NSD2O96028 1365 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF10O15013 1369 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 NLRP6P59044 892 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 COG3Q96JB2 828 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXA4-202ENST00000428284 USP31Q70CQ4 1352 aa28.07■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHG5O94827 1062 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 NLRP13Q86W25 1043 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 ABCA3Q99758 1704 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 MORC1Q86VD1 984 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 SHPRHQ149N8 1683 aa28.03■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.01■■■□□ 2.08
HOXA4-202ENST00000428284 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 ANP32CO43423 234 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 SLIT3O75094 1523 aa28■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 PARD3Q8TEW0 1356 aa28■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 SOX12O15370 315 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 USP19O94966 1318 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 LTN1O94822 1766 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 JCADQ9P266 1359 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 RALBP1Q15311 655 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXA4-202ENST00000428284 NFAT5O94916 1531 aa27.95■■■□□ 2.06
HOXA4-202ENST00000428284 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
HOXA4-202ENST00000428284 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXA4-202ENST00000428284 GCP02774 474 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXA4-202ENST00000428284 FBLN1P23142 703 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXA4-202ENST00000428284 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.89■■■□□ 2.06
HOXA4-202ENST00000428284 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 PPP2R1AP30153 589 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 PEAK1Q9H792 1746 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 POLKQ9UBT6 870 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXA4-202ENST00000428284 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA0232Q92628 1395 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 RGPD5Q99666 1765 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 MTHFSP49914 203 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 CPDO75976 1380 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 MIER1Q8N108 512 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 AMPHP49418 695 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 COL18A1P39060 1754 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS2O95450 1211 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 LRP6O75581 1613 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXA4-202ENST00000428284 RTL1A6NKG5 1358 aa27.77■■■□□ 2.04
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