RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.32■■□□□ 1.48
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.31■■□□□ 1.48
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITSN1Q15811 1721 aa24.28■■□□□ 1.48
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.24■■□□□ 1.47
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.23■■□□□ 1.47
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NME9Q86XW9 330 aa24.23■■□□□ 1.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.23■■□□□ 1.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.22■■□□□ 1.47
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.22■■□□□ 1.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.2■■□□□ 1.47
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SKAP1Q86WV1 359 aa24.2■■□□□ 1.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.2■■□□□ 1.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCHSD2O94868 740 aa24.19■■□□□ 1.46
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.08■■□□□ 1.44
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP6P35125 1406 aa24.07■■□□□ 1.44
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.06■■□□□ 1.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFE2L2Q16236 605 aa24.06■■□□□ 1.44
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.05■■□□□ 1.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.05■■□□□ 1.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.05■■□□□ 1.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.04■■□□□ 1.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.03■■□□□ 1.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSH2Q76I76 1423 aa24.01■■□□□ 1.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLG5Q8TDM6 1919 aa24■■□□□ 1.43
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS3P49796 1198 aa24■■□□□ 1.43
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