RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424529.6

VGLL4-208, Transcript of vestigial like family member 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VGLL4, Length 1,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4-208ENST00000424529 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
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VGLL4-208ENST00000424529 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
VGLL4-208ENST00000424529 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.21■■■□□ 2.43
VGLL4-208ENST00000424529 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.19■■■□□ 2.42
VGLL4-208ENST00000424529 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
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VGLL4-208ENST00000424529 NRKQ7Z2Y5 1582 aa30.18■■■□□ 2.42
VGLL4-208ENST00000424529 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
VGLL4-208ENST00000424529 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.17■■■□□ 2.42
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VGLL4-208ENST00000424529 ABTB2Q8N961 1025 aa30.11■■■□□ 2.41
VGLL4-208ENST00000424529 A0A1W2PP64 1363 aa30.11■■■□□ 2.41
VGLL4-208ENST00000424529 PIK3C2AO00443 1686 aa30.11■■■□□ 2.41
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VGLL4-208ENST00000424529 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
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VGLL4-208ENST00000424529 NLRP13Q86W25 1043 aa30.04■■■□□ 2.4
VGLL4-208ENST00000424529 SLIT3O75094 1523 aa30.04■■■□□ 2.4
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VGLL4-208ENST00000424529 USP31Q70CQ4 1352 aa30.03■■■□□ 2.4
VGLL4-208ENST00000424529 USP54Q70EL1 1684 aa30.02■■■□□ 2.4
VGLL4-208ENST00000424529 NLRP6P59044 892 aa30.01■■■□□ 2.39
VGLL4-208ENST00000424529 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
VGLL4-208ENST00000424529 USP21Q9UK80 565 aa30■■■□□ 2.39
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VGLL4-208ENST00000424529 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
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VGLL4-208ENST00000424529 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
VGLL4-208ENST00000424529 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.92■■■□□ 2.38
VGLL4-208ENST00000424529 NRAPQ86VF7 1730 aa29.92■■■□□ 2.38
VGLL4-208ENST00000424529 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
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VGLL4-208ENST00000424529 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.9■■■□□ 2.38
VGLL4-208ENST00000424529 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.9■■■□□ 2.38
VGLL4-208ENST00000424529 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
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VGLL4-208ENST00000424529 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.88■■■□□ 2.37
VGLL4-208ENST00000424529 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
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VGLL4-208ENST00000424529 CHRNA2Q15822 529 aa29.87■■■□□ 2.37
VGLL4-208ENST00000424529 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.87■■■□□ 2.37
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VGLL4-208ENST00000424529 COL18A1P39060 1754 aa29.85■■■□□ 2.37
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VGLL4-208ENST00000424529 GLI3P10071 1580 aa29.83■■■□□ 2.37
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VGLL4-208ENST00000424529 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.81■■■□□ 2.36
VGLL4-208ENST00000424529 RGS12O14924 1447 aa29.79■■■□□ 2.36
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VGLL4-208ENST00000424529 PANK3Q9H999 370 aa29.78■■■□□ 2.36
VGLL4-208ENST00000424529 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.77■■■□□ 2.36
VGLL4-208ENST00000424529 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.77■■■□□ 2.36
VGLL4-208ENST00000424529 ABCC6O95255 1503 aa29.76■■■□□ 2.36
VGLL4-208ENST00000424529 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
VGLL4-208ENST00000424529 COG3Q96JB2 828 aa29.76■■■□□ 2.35
VGLL4-208ENST00000424529 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.76■■■□□ 2.35
VGLL4-208ENST00000424529 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.75■■■□□ 2.35
VGLL4-208ENST00000424529 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
VGLL4-208ENST00000424529 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.74■■■□□ 2.35
VGLL4-208ENST00000424529 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.74■■■□□ 2.35
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