RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 PTPRNQ16849 979 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC82-202ENST00000423339 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC82-202ENST00000423339 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC82-202ENST00000423339 HLA-CQ95604 372 aa7.04□□□□□ -1.28
CCDC82-202ENST00000423339 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.03□□□□□ -1.28
CCDC82-202ENST00000423339 LINC01559Q495D7 138 aa7.02□□□□□ -1.28
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF511Q8NB15 262 aa7.02□□□□□ -1.28
CCDC82-202ENST00000423339 BAP1Q92560 729 aa7.02□□□□□ -1.28
CCDC82-202ENST00000423339 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.02□□□□□ -1.28
CCDC82-202ENST00000423339 KCNH2Q12809 1159 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.02□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.01□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 BMP2P12643 396 aa7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 SVOPQ8N4V2 548 aa7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 C6orf229H3BNL8 230 aa7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 IRS1P35568 1242 aa7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 GUCA2AQ02747 115 aa7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 NR5A1Q13285 461 aa7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 SPTLC1O15269 473 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 MAP2K5Q13163 448 aa6.99□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 FDX1P10109 184 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.299e-10■■■□□ 16.6
CCDC82-202ENST00000423339 CDK15Q96Q40 435 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 XP32Q5T750 250 aa6.98□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 KRT76Q01546 638 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.97□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.96□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.96□□□□□ -1.29
CCDC82-202ENST00000423339 CLCN1P35523 988 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 DESI1Q6ICB0 168 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 MEIOBQ8N635 442 aa6.96□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.95□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 ARID5BQ14865 1188 aa6.95□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 ITPKCQ96DU7 683 aa6.95□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.94□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.94□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 SLURP2P0DP57 97 aa6.94□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 IRF6O14896 467 aa6.93□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 ARHGEF15O94989 841 aa6.93□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 MSTNO14793 375 aa6.92□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 ZMYND10O75800 440 aa6.92□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 CTHP32929 405 aa6.92□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 MAP3K10Q02779 954 aa6.92□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 PRR7Q8TB68 274 aa6.92□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 TTLL8A6PVC2 850 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 ADAM23O75077 832 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 PTSQ03393 145 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.91□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 BARGINQ6ZT62 677 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 SV2AQ7L0J3 742 aa6.9□□□□□ -1.3
CCDC82-202ENST00000423339 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.9□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 NR3C2P08235 984 aa6.9□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 AGERQ15109 404 aa6.9□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.9□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 MTMR2Q13614 643 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.89□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 WHAMMQ8TF30 809 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 FOXJ1Q92949 421 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 GRM5P41594 1212 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 LYPD8Q6UX82 237 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.87□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.86□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 ITGA6P23229 1130 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC102AQ96A19 550 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 CDC14CA4D256 554 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 SLC35F4A4IF30 521 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 PODNQ7Z5L7 613 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC82-202ENST00000423339 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-202ENST00000423339 ADAMTS2O95450 1211 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-202ENST00000423339 FSHRP23945 695 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-202ENST00000423339 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-202ENST00000423339 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-202ENST00000423339 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms