RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP12Q02952 1782 aa23.03■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.02■■□□□ 1.28
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOM1O60784 492 aa23.01■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 MORC1Q86VD1 984 aa23■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 CERKQ8TCT0 537 aa23■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 NME9Q86XW9 330 aa22.99■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.99■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCER2I3L3R5 266 aa22.97■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 COG3Q96JB2 828 aa22.97■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 SBNO1A3KN83 1393 aa22.95■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP31Q70CQ4 1352 aa22.95■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABTB2Q8N961 1025 aa22.93■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PXDNQ92626 1479 aa22.92■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP13Q86W25 1043 aa22.92■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.92■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.92■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.91■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP2R1AP30153 589 aa22.91■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRP6P59044 892 aa22.9■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.89■■□□□ 1.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.88■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.87■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.87■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.87■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF10O15013 1369 aa22.86■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIK3C2AO00443 1686 aa22.85■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.85■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIP4K2BP78356 416 aa22.85■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.85■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.85■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRS2Q9HD23 443 aa22.84■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.84■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.83■■□□□ 1.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.82■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP19O94966 1318 aa22.82■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP54Q70EL1 1684 aa22.81■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTHFSP49914 203 aa22.8■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALS2Q96Q42 1657 aa22.79■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC184Q52MB2 194 aa22.78■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP53Q96M91 514 aa22.78■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLKQ9UBT6 870 aa22.78■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLIT3O75094 1523 aa22.77■■□□□ 1.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 GCP02774 474 aa22.76■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBLN1P23142 703 aa22.75■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.74■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.74■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOX12O15370 315 aa22.74■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.74■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 INSRP06213 1382 aa22.73■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.72■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 NFAT5O94916 1531 aa22.71■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 RTL1A6NKG5 1358 aa22.69■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLT4P35916 1363 aa22.69■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.69■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMPHP49418 695 aa22.68■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHLPP1O60346 1717 aa22.67■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.67■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHG5O94827 1062 aa22.66■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDCQ9Y266 331 aa22.66■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 CPDO75976 1380 aa22.66■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.65■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXC9P31274 260 aa22.64■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 IP6K1Q92551 441 aa22.64■■□□□ 1.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.62■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 JCADQ9P266 1359 aa22.61■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.6■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL13P35225 146 aa22.6■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC6O95255 1503 aa22.59■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PEAK1Q9H792 1746 aa22.59■■□□□ 1.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms