RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.89■■□□□ 1.74
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PTPRJ-201ENST00000418331 ABCC5O15440 1437 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-201ENST00000418331 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.88■■□□□ 1.73
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PTPRJ-201ENST00000418331 MBD3O95983 291 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRJ-201ENST00000418331 SRGAP3O43295 1099 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRJ-201ENST00000418331 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRJ-201ENST00000418331 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.65■■□□□ 1.7
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