RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.06□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 DDRGK1Q96HY6 314 aa8.06□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.06□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 CFAP99D6REC4 459 aa8.05□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 LILRB3O75022 631 aa8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 QPCTQ16769 361 aa8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 BAP1Q92560 729 aa8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM117AQ9C073 453 aa8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 SIAH2O43255 324 aa8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 LYPD8Q6UX82 237 aa8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCNH2Q12809 1159 aa8.02□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.02□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.01□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTHP32929 405 aa8.01□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAP10Q9P2G4 905 aa8.01□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 BMP1P13497 986 aa8□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 NEUROD2Q15784 382 aa7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF511Q8NB15 262 aa7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 TSC1Q92574 1164 aa7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 TREML4Q6UXN2 200 aa7.98□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.98□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 HOMEZQ8IX15 550 aa7.97□□□□□ -1.13
RPS3AP9-201ENST00000417027 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXJ1Q92949 421 aa7.96□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIM47Q96LD4 638 aa7.96□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 LCE2CQ5TA81 110 aa7.95□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.95□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.94□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 GOPCQ9HD26 462 aa7.94□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 WFS1O76024 890 aa7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 SENP2Q9HC62 589 aa7.93□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 NNTQ13423 1086 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 AGERQ15109 404 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARID5BQ14865 1188 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 IL27Q8NEV9 243 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.91□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RPS3AP9-201ENST00000417027 NBPF14Q5TI25 921 aa7.89□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIFC2Q96AC6 838 aa7.89□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 TIMP2P16035 220 aa7.88□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 MPNDQ8N594 471 aa7.88□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 AP1G2O75843 785 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADH1CP00326 375 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 NR3C2P08235 984 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 RFC5P40937 340 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 VEGFBP49765 207 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZFP42Q96MM3 310 aa7.87□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.86□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 SOBPA7XYQ1 873 aa7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 USP17L8P0C7I0 530 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 ITPKCQ96DU7 683 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 CDK15Q96Q40 435 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.84□□□□□ -1.15
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 GRM5P41594 1212 aa7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 NR6A1Q15406 480 aa7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.83□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 FSHRP23945 695 aa7.82□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.2 ms