RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.33■■□□□ 1.81
SUMO3-204ENST00000411651 PTCH1Q13635 1447 aa26.32■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 ITSN1Q15811 1721 aa26.32■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 PLIN1O60240 522 aa26.32■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.32■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 CRBNQ96SW2 442 aa26.31■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 TBX22Q9Y458 520 aa26.31■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.3■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.3■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.29■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SUMO3-204ENST00000411651 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.26■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 PTPRUQ92729 1446 aa26.25■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.25■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 IL16Q14005 1332 aa26.24■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 PDE3AQ14432 1141 aa26.24■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 POLKQ9UBT6 870 aa26.24■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 PIK3R4Q99570 1358 aa26.23■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.23■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 FCHSD2O94868 740 aa26.23■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.23■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.23■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.22■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
SUMO3-204ENST00000411651 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 NEUROD2Q15784 382 aa26.2■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 COG3Q96JB2 828 aa26.18■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.18■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 MS4A1P11836 297 aa26.18■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 AAMPQ13685 434 aa26.18■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.17■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 BCAR3O75815 825 aa26.16■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 NME9Q86XW9 330 aa26.16■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.15■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 USP6P35125 1406 aa26.14■■□□□ 1.78
SUMO3-204ENST00000411651 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.14■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.14■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.13■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.13■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.13■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.13■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 SSH2Q76I76 1423 aa26.12■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.11■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 NEFMP07197 916 aa26.11■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.11■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 IL13P35225 146 aa26.1■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 ACEP12821 1306 aa26.1■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.09■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.09■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.09■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 USP31Q70CQ4 1352 aa26.08■■□□□ 1.77
SUMO3-204ENST00000411651 RIPK4P57078 832 aa26.07■■□□□ 1.76
SUMO3-204ENST00000411651 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.07■■□□□ 1.76
SUMO3-204ENST00000411651 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SUMO3-204ENST00000411651 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SUMO3-204ENST00000411651 PRKAR2BP31323 418 aa26.04■■□□□ 1.76
SUMO3-204ENST00000411651 NFE2L2Q16236 605 aa26.03■■□□□ 1.76
SUMO3-204ENST00000411651 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-204ENST00000411651 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF428Q96B54 188 aa26.02■■□□□ 1.76
SUMO3-204ENST00000411651 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SUMO3-204ENST00000411651 FMN2Q9NZ56 1722 aa26■■□□□ 1.75
SUMO3-204ENST00000411651 FBLN1P23142 703 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-204ENST00000411651 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.99■■□□□ 1.75
SUMO3-204ENST00000411651 USP54Q70EL1 1684 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-204ENST00000411651 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-204ENST00000411651 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SUMO3-204ENST00000411651 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.97■■□□□ 1.75
SUMO3-204ENST00000411651 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.95■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 BACH2Q9BYV9 841 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 KCNA6P17658 529 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.94■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.93■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 PANK1Q8TE04 598 aa25.93■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 PDE4AP27815 886 aa25.92■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.92■■□□□ 1.74
SUMO3-204ENST00000411651 COG6Q9Y2V7 657 aa25.92■■□□□ 1.74
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