RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 PHLPP1O60346 1717 aa45.77■■■■■ 4.92
CSNK1E-204ENST00000403904 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP45.76■■■■■ 4.92
CSNK1E-204ENST00000403904 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP45.75■■■■■ 4.92
CSNK1E-204ENST00000403904 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa45.74■■■■■ 4.91
CSNK1E-204ENST00000403904 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP45.72■■■■■ 4.91
CSNK1E-204ENST00000403904 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP45.71■■■■■ 4.91
CSNK1E-204ENST00000403904 KNSTRNQ9Y448 316 aa45.7■■■■■ 4.91
CSNK1E-204ENST00000403904 SBNO1A3KN83 1393 aa45.69■■■■■ 4.91
CSNK1E-204ENST00000403904 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP45.67■■■■■ 4.9
CSNK1E-204ENST00000403904 FBXO41Q8TF61 875 aa45.66■■■■■ 4.9
CSNK1E-204ENST00000403904 TTC21AQ8NDW8 1320 aa45.66■■■■■ 4.9
CSNK1E-204ENST00000403904 LMOD2Q6P5Q4 547 aa45.65■■■■■ 4.9
CSNK1E-204ENST00000403904 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa45.65■■■■■ 4.9
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CSNK1E-204ENST00000403904 TNS3Q68CZ2 1445 aa45.63■■■■■ 4.9
CSNK1E-204ENST00000403904 ABTB2Q8N961 1025 aa45.62■■■■■ 4.89
CSNK1E-204ENST00000403904 ALS2Q96Q42 1657 aa45.62■■■■■ 4.89
CSNK1E-204ENST00000403904 CGNL1Q0VF96 1302 aa45.62■■■■■ 4.89
CSNK1E-204ENST00000403904 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
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CSNK1E-204ENST00000403904 PIK3C2AO00443 1686 aa45.61■■■■■ 4.89
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CSNK1E-204ENST00000403904 NUTM2GQ5VZR2 741 aa45.59■■■■■ 4.89
CSNK1E-204ENST00000403904 KIF20BQ96Q89 1820 aa45.58■■■■■ 4.89
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CSNK1E-204ENST00000403904 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP45.57■■■■■ 4.89
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CSNK1E-204ENST00000403904 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
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CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGEF10O15013 1369 aa45.52■■■■■ 4.88
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CSNK1E-204ENST00000403904 USP31Q70CQ4 1352 aa45.46■■■■■ 4.87
CSNK1E-204ENST00000403904 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
CSNK1E-204ENST00000403904 COG3Q96JB2 828 aa45.45■■■■■ 4.87
CSNK1E-204ENST00000403904 NSD2O96028 1365 aa45.44■■■■■ 4.87
CSNK1E-204ENST00000403904 PNPLA6Q8IY17 1366 aa45.44■■■■■ 4.87
CSNK1E-204ENST00000403904 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa45.44■■■■■ 4.86
CSNK1E-204ENST00000403904 OVOS2Q6IE36 1432 aa45.44■■■■■ 4.86
CSNK1E-204ENST00000403904 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa45.43■■■■■ 4.86
CSNK1E-204ENST00000403904 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa45.42■■■■■ 4.86
CSNK1E-204ENST00000403904 USP54Q70EL1 1684 aa45.41■■■■■ 4.86
CSNK1E-204ENST00000403904 CABLES1Q8TDN4 633 aa45.4■■■■■ 4.86
CSNK1E-204ENST00000403904 JCADQ9P266 1359 aa45.38■■■■■ 4.86
CSNK1E-204ENST00000403904 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP45.38■■■■■ 4.86
CSNK1E-204ENST00000403904 SHPRHQ149N8 1683 aa45.37■■■■■ 4.85
CSNK1E-204ENST00000403904 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP45.37■■■■■ 4.85
CSNK1E-204ENST00000403904 USP19O94966 1318 aa45.36■■■■■ 4.85
CSNK1E-204ENST00000403904 MORC1Q86VD1 984 aa45.35■■■■■ 4.85
CSNK1E-204ENST00000403904 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa45.34■■■■■ 4.85
CSNK1E-204ENST00000403904 SOX12O15370 315 aa45.33■■■■■ 4.85
CSNK1E-204ENST00000403904 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
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CSNK1E-204ENST00000403904 ABCA3Q99758 1704 aa45.29■■■■■ 4.84
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CSNK1E-204ENST00000403904 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
CSNK1E-204ENST00000403904 PARD3Q8TEW0 1356 aa45.21■■■■■ 4.83
CSNK1E-204ENST00000403904 NFAT5O94916 1531 aa45.2■■■■■ 4.83
CSNK1E-204ENST00000403904 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
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CSNK1E-204ENST00000403904 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa45.17■■■■■ 4.82
CSNK1E-204ENST00000403904 ANP32CO43423 234 aa45.16■■■■■ 4.82
CSNK1E-204ENST00000403904 RALBP1Q15311 655 aa45.16■■■■■ 4.82
CSNK1E-204ENST00000403904 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
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CSNK1E-204ENST00000403904 ZBTB7CA1YPR0 619 aa45.11■■■■■ 4.81
CSNK1E-204ENST00000403904 LTN1O94822 1766 aa45.11■■■■■ 4.81
CSNK1E-204ENST00000403904 KIAA0232Q92628 1395 aa45.1■■■■■ 4.81
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CSNK1E-204ENST00000403904 MAP3K19Q56UN5 1328 aa45.08■■■■■ 4.81
CSNK1E-204ENST00000403904 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa45.07■■■■■ 4.81
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CSNK1E-204ENST00000403904 CPDO75976 1380 aa45.05■■■■■ 4.8
CSNK1E-204ENST00000403904 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP45.03■■■■■ 4.8
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CSNK1E-204ENST00000403904 AMPHP49418 695 aa44.99■■■■■ 4.79
CSNK1E-204ENST00000403904 PEAK1Q9H792 1746 aa44.99■■■■■ 4.79
CSNK1E-204ENST00000403904 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
CSNK1E-204ENST00000403904 COL18A1P39060 1754 aa44.94■■■■■ 4.79
CSNK1E-204ENST00000403904 HOXC9P31274 260 aa44.93■■■■■ 4.78
CSNK1E-204ENST00000403904 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
CSNK1E-204ENST00000403904 IP6K1Q92551 441 aa44.92■■■■■ 4.78
CSNK1E-204ENST00000403904 AXIN2Q9Y2T1 843 aa44.92■■■■■ 4.78
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