RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa41.87■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.87■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 POLR3GLQ9BT43 218 aa41.87■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 TERF2IPQ9NYB0 399 aa41.86■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PP64 1363 aa41.86■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF10O15013 1369 aa41.84■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 NRKQ7Z2Y5 1582 aa41.83■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 KIF7Q2M1P5 1343 aa41.8■■■■■ 4.28
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa41.8■■■■■ 4.28
PKDCC-202ENST00000401498 LRP6O75581 1613 aa41.79■■■■■ 4.28
PKDCC-202ENST00000401498 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa41.78■■■■■ 4.28
PKDCC-202ENST00000401498 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
PKDCC-202ENST00000401498 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
PKDCC-202ENST00000401498 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
PKDCC-202ENST00000401498 ABTB2Q8N961 1025 aa41.76■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.74■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 NUTM2GQ5VZR2 741 aa41.73■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 PIK3C2AO00443 1686 aa41.72■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHG5O94827 1062 aa41.72■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 TTC21AQ8NDW8 1320 aa41.71■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 ABCA3Q99758 1704 aa41.7■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 WASHC2AQ641Q2 1341 aa41.7■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP41.7■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.7■■■■■ 4.27
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC7Q96M83 1385 aa41.68■■■■■ 4.26
PKDCC-202ENST00000401498 CARD14Q9BXL6 1004 aa41.65■■■■■ 4.26
PKDCC-202ENST00000401498 NLRP6P59044 892 aa41.63■■■■■ 4.26
PKDCC-202ENST00000401498 NLRP13Q86W25 1043 aa41.63■■■■■ 4.26
PKDCC-202ENST00000401498 ADAMTS2O95450 1211 aa41.63■■■■■ 4.25
PKDCC-202ENST00000401498 NME9Q86XW9 330 aa41.62■■■■■ 4.25
PKDCC-202ENST00000401498 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
PKDCC-202ENST00000401498 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
PKDCC-202ENST00000401498 USP19O94966 1318 aa41.6■■■■■ 4.25
PKDCC-202ENST00000401498 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
PKDCC-202ENST00000401498 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
PKDCC-202ENST00000401498 PANK3Q9H999 370 aa41.59■■■■■ 4.25
PKDCC-202ENST00000401498 ZRANB1Q9UGI0 708 aa41.59■■■■■ 4.25
PKDCC-202ENST00000401498 NSD3Q9BZ95 1437 aa41.56■■■■■ 4.24
PKDCC-202ENST00000401498 USP31Q70CQ4 1352 aa41.56■■■■■ 4.24
PKDCC-202ENST00000401498 USP54Q70EL1 1684 aa41.54■■■■■ 4.24
PKDCC-202ENST00000401498 SLIT3O75094 1523 aa41.52■■■■■ 4.24
PKDCC-202ENST00000401498 C8orf37Q96NL8 207 aa41.51■■■■■ 4.24
PKDCC-202ENST00000401498 GCP02774 474 aa41.5■■■■■ 4.23
PKDCC-202ENST00000401498 FYB1O15117 783 aa41.5■■■■■ 4.23
PKDCC-202ENST00000401498 KIF20BQ96Q89 1820 aa41.48■■■■■ 4.23
PKDCC-202ENST00000401498 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa41.47■■■■■ 4.23
PKDCC-202ENST00000401498 OVOS2Q6IE36 1432 aa41.47■■■■■ 4.23
PKDCC-202ENST00000401498 NGLY1Q96IV0 654 aa41.45■■■■■ 4.23
PKDCC-202ENST00000401498 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 GGNBP2Q9H3C7 697 aa41.43■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 FAM83GA6ND36 823 aa41.42■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA0232Q92628 1395 aa41.41■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 AFF2P51816 1311 aa41.4■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 CGNL1Q0VF96 1302 aa41.4■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 KCNH5Q8NCM2 988 aa41.4■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 COG3Q96JB2 828 aa41.4■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 SOX12O15370 315 aa41.39■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.22
PKDCC-202ENST00000401498 NFAT5O94916 1531 aa41.38■■■■■ 4.21
PKDCC-202ENST00000401498 CPDO75976 1380 aa41.38■■■■■ 4.21
PKDCC-202ENST00000401498 PRDM11Q9NQV5 511 aa41.37■■■■■ 4.21
PKDCC-202ENST00000401498 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
PKDCC-202ENST00000401498 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
PKDCC-202ENST00000401498 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.35■■■■■ 4.21
PKDCC-202ENST00000401498 SLIT2O94813 1529 aa41.35■■■■■ 4.21
PKDCC-202ENST00000401498 KNSTRNQ9Y448 316 aa41.34■■■■■ 4.21
PKDCC-202ENST00000401498 CHRNA2Q15822 529 aa41.33■■■■■ 4.21
PKDCC-202ENST00000401498 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.31■■■■■ 4.2
PKDCC-202ENST00000401498 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.3■■■■■ 4.2
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF25Q86VW2 580 aa41.29■■■■■ 4.2
PKDCC-202ENST00000401498 USP21Q9UK80 565 aa41.29■■■■■ 4.2
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa41.29■■■■■ 4.2
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
PKDCC-202ENST00000401498 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
PKDCC-202ENST00000401498 FBLN1P23142 703 aa41.26■■■■■ 4.2
PKDCC-202ENST00000401498 BTG4Q9NY30 223 aa41.26■■■■■ 4.2
PKDCC-202ENST00000401498 LMO7Q8WWI1 1683 aa41.25■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 ZBTB7CA1YPR0 619 aa41.25■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 LTN1O94822 1766 aa41.25■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 COL18A1P39060 1754 aa41.25■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 NSD2O96028 1365 aa41.23■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.23■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 AATKQ6ZMQ8 1374 aa41.23■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 POTEAQ6S8J7 498 aa41.22■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 NRAPQ86VF7 1730 aa41.22■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa41.22■■■■■ 4.19
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
PKDCC-202ENST00000401498 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
PKDCC-202ENST00000401498 AXIN2Q9Y2T1 843 aa41.17■■■■■ 4.18
PKDCC-202ENST00000401498 RGPD5Q99666 1765 aa41.16■■■■■ 4.18
PKDCC-202ENST00000401498 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
PKDCC-202ENST00000401498 ATRNO75882 1429 aa41.15■■■■■ 4.18
PKDCC-202ENST00000401498 MAP3K19Q56UN5 1328 aa41.15■■■■■ 4.18
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