RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 RGL3Q3MIN7 710 aa10.37□□□□□ -0.75
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CTXN3-201ENST00000379445 AFF2P51816 1311 aa10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-201ENST00000379445 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CTXN3-201ENST00000379445 ABCC11Q96J66 1382 aa10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-201ENST00000379445 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10.35□□□□□ -0.75
CTXN3-201ENST00000379445 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-201ENST00000379445 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-201ENST00000379445 KNDC1Q76NI1 1749 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-201ENST00000379445 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.34□□□□□ -0.75
CTXN3-201ENST00000379445 MYOM2P54296 1465 aa10.34□□□□□ -0.75
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CTXN3-201ENST00000379445 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.33□□□□□ -0.76
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CTXN3-201ENST00000379445 RXRBP28702 533 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM132EQ6IEE7 984 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.33□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 C8orf37Q96NL8 207 aa10.33□□□□□ -0.76
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CTXN3-201ENST00000379445 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.32□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 RGS12O14924 1447 aa10.31□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 ADAMTS2O95450 1211 aa10.31□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.31□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
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CTXN3-201ENST00000379445 FOXO3O43524 673 aa10.29□□□□□ -0.76
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CTXN3-201ENST00000379445 CFAP70Q5T0N1 1121 aa10.29□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.29□□□□□ -0.76
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CTXN3-201ENST00000379445 ADGRB1O14514 1584 aa10.28□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 OTUD5Q96G74 571 aa10.28□□□□□ -0.76
CTXN3-201ENST00000379445 DLC1Q96QB1 1528 aa10.27□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 ATRNO75882 1429 aa10.26□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 KIF1AQ12756 1690 aa10.26□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 USP21Q9UK80 565 aa10.26□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 BCL9LQ86UU0 1499 aa10.26□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.25□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 PRAM1Q96QH2 718 aa10.25□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 ADGRB2O60241 1585 aa10.25□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
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CTXN3-201ENST00000379445 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.23□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.23□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.23□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 EP400Q96L91 3159 aa10.23□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 SLIT2O94813 1529 aa10.23□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
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CTXN3-201ENST00000379445 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.22□□□□□ -0.77
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CTXN3-201ENST00000379445 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 SBNO1A3KN83 1393 aa10.21□□□□□ -0.77
CTXN3-201ENST00000379445 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.21□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 STAC3Q96MF2 364 aa10.21□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.21□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.21□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.2□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 MIER1Q8N108 512 aa10.2□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 POGKQ9P215 609 aa10.2□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.2□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.2□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.2□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 POTEB2H3BUK9 544 aa10.19□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 GLI3P10071 1580 aa10.19□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.19□□□□□ -0.78
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CTXN3-201ENST00000379445 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 PSME1Q06323 249 aa10.18□□□□□ -0.78
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CTXN3-201ENST00000379445 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 UNC5CLQ8IV45 518 aa10.18□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
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CTXN3-201ENST00000379445 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.18□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 SPOCK2Q92563 424 aa10.18□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 ABCA3Q99758 1704 aa10.17□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 PLEKHG5O94827 1062 aa10.16□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 ATP7BP35670 1465 aa10.16□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CTXN3-201ENST00000379445 VPS72Q15906 364 aa10.15□□□□□ -0.79
CTXN3-201ENST00000379445 KIF12Q96FN5 646 aa10.15□□□□□ -0.79
CTXN3-201ENST00000379445 ALS2Q96Q42 1657 aa10.15□□□□□ -0.79
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