RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
PDSS1-201ENST00000376215 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
PDSS1-201ENST00000376215 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
PDSS1-201ENST00000376215 ALS2Q96Q42 1657 aa32.39■■■□□ 2.78
PDSS1-201ENST00000376215 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa32.39■■■□□ 2.78
PDSS1-201ENST00000376215 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
PDSS1-201ENST00000376215 PIK3C2AO00443 1686 aa32.38■■■□□ 2.77
PDSS1-201ENST00000376215 KIF20BQ96Q89 1820 aa32.37■■■□□ 2.77
PDSS1-201ENST00000376215 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.37■■■□□ 2.77
PDSS1-201ENST00000376215 SBNO1A3KN83 1393 aa32.37■■■□□ 2.77
PDSS1-201ENST00000376215 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
PDSS1-201ENST00000376215 TNS3Q68CZ2 1445 aa32.34■■■□□ 2.77
PDSS1-201ENST00000376215 TTC21AQ8NDW8 1320 aa32.33■■■□□ 2.77
PDSS1-201ENST00000376215 KNSTRNQ9Y448 316 aa32.33■■■□□ 2.77
PDSS1-201ENST00000376215 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa32.32■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 NME9Q86XW9 330 aa32.31■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.29■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 FYB1O15117 783 aa32.29■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 FBXO41Q8TF61 875 aa32.29■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 USP54Q70EL1 1684 aa32.28■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa32.27■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 HSPA1LP34931 641 aa32.27■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 ABTB2Q8N961 1025 aa32.27■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.27■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.76
PDSS1-201ENST00000376215 NUTM2GQ5VZR2 741 aa32.26■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 LMOD2Q6P5Q4 547 aa32.26■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 GGNBP2Q9H3C7 697 aa32.25■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF10O15013 1369 aa32.23■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 USP31Q70CQ4 1352 aa32.22■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa32.22■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 OVOS2Q6IE36 1432 aa32.22■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa32.22■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa32.22■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 NSD2O96028 1365 aa32.2■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 NLRP6P59044 892 aa32.2■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
PDSS1-201ENST00000376215 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 PNPLA6Q8IY17 1366 aa32.19■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 SHPRHQ149N8 1683 aa32.19■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 ABCA3Q99758 1704 aa32.18■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 NLRP13Q86W25 1043 aa32.16■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 COG3Q96JB2 828 aa32.15■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 USP19O94966 1318 aa32.15■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 SLIT3O75094 1523 aa32.14■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 PLEKHG5O94827 1062 aa32.14■■■□□ 2.74
PDSS1-201ENST00000376215 CABLES1Q8TDN4 633 aa32.13■■■□□ 2.73
PDSS1-201ENST00000376215 JCADQ9P266 1359 aa32.12■■■□□ 2.73
PDSS1-201ENST00000376215 NFAT5O94916 1531 aa32.08■■■□□ 2.73
PDSS1-201ENST00000376215 MORC1Q86VD1 984 aa32.08■■■□□ 2.73
PDSS1-201ENST00000376215 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
PDSS1-201ENST00000376215 PARD3Q8TEW0 1356 aa32.07■■■□□ 2.72
PDSS1-201ENST00000376215 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
PDSS1-201ENST00000376215 SOX12O15370 315 aa32.05■■■□□ 2.72
PDSS1-201ENST00000376215 GCP02774 474 aa32.05■■■□□ 2.72
PDSS1-201ENST00000376215 FBLN1P23142 703 aa32.05■■■□□ 2.72
PDSS1-201ENST00000376215 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
PDSS1-201ENST00000376215 LTN1O94822 1766 aa32.03■■■□□ 2.72
PDSS1-201ENST00000376215 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
PDSS1-201ENST00000376215 KCNH5Q8NCM2 988 aa32.01■■■□□ 2.72
PDSS1-201ENST00000376215 AATKQ6ZMQ8 1374 aa31.98■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa31.97■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 RALBP1Q15311 655 aa31.97■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 ANP32CO43423 234 aa31.96■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 LRP6O75581 1613 aa31.95■■■□□ 2.71
PDSS1-201ENST00000376215 PEAK1Q9H792 1746 aa31.95■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 KIAA0232Q92628 1395 aa31.93■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 MAP3K19Q56UN5 1328 aa31.93■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 PPP2R1AP30153 589 aa31.93■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF25Q86VW2 580 aa31.93■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 POLKQ9UBT6 870 aa31.93■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 CPDO75976 1380 aa31.93■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa31.92■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 COL18A1P39060 1754 aa31.91■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 RGPD5Q99666 1765 aa31.89■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 ADAMTS2O95450 1211 aa31.89■■■□□ 2.7
PDSS1-201ENST00000376215 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 ZBTB7CA1YPR0 619 aa31.87■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 LMO7Q8WWI1 1683 aa31.86■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 MTHFSP49914 203 aa31.86■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 CHRNA2Q15822 529 aa31.86■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 PRDM11Q9NQV5 511 aa31.86■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 FAM83GA6ND36 823 aa31.85■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 ABCC6O95255 1503 aa31.83■■■□□ 2.69
PDSS1-201ENST00000376215 PLCH1Q4KWH8 1693 aa31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms