RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.21■□□□□ 0.03
CLRN3-201ENST00000368671 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.21■□□□□ 0.03
CLRN3-201ENST00000368671 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.21■□□□□ 0.03
CLRN3-201ENST00000368671 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.2■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.19■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.19■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 AKT1S1Q96B36 256 aa15.19■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.19■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 SBNO1A3KN83 1393 aa15.19■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 BRWD3Q6RI45 1802 aa15.19■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGEF10O15013 1369 aa15.17■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.16■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.15■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 ALS2Q96Q42 1657 aa15.15■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.15■□□□□ 0.02
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC125Q86Z20 511 aa15.14■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 NRAPQ86VF7 1730 aa15.14■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.13■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 ITSN1Q15811 1721 aa15.13■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 VPS72Q15906 364 aa15.13■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.12■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.12■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 FAM83GA6ND36 823 aa15.11■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.11■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 A0A0G2JS52 829 aa15.1■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 MYT1Q01538 1121 aa15.1■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 STAC3Q96MF2 364 aa15.1■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 HRCP23327 699 aa15.09■□□□□ 0.01
CLRN3-201ENST00000368671 BTG4Q9NY30 223 aa15.08■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 ATP7BP35670 1465 aa15.08■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.07■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.07■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa15.06■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.06■□□□□ 0
CLRN3-201ENST00000368671 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CLRN3-201ENST00000368671 CDK19Q9BWU1 502 aa15.04■□□□□ -0
CLRN3-201ENST00000368671 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.03■□□□□ -0
CLRN3-201ENST00000368671 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.02■□□□□ -0
CLRN3-201ENST00000368671 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
CLRN3-201ENST00000368671 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.01□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 RGPD1P0DJD0 1748 aa15□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 KIAA0232Q92628 1395 aa15□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa15□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 ACEP12821 1306 aa15□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa15□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa15□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 CHRNA2Q15822 529 aa15□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 EP400Q96L91 3159 aa15□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.99□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 FAM182BQ5T319 152 aa14.99□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 STRN4Q9NRL3 753 aa14.99□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 NRKQ7Z2Y5 1582 aa14.98□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.98□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 BAG6P46379 1132 aa14.98□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.98□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.97□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
CLRN3-201ENST00000368671 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.95□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.95□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.95□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 ABTB2Q8N961 1025 aa14.95□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 EVA1CP58658 441 aa14.94□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 USP35Q9P2H5 1018 aa14.94□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 CABP2Q9NPB3 220 aa14.93□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.93□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 SSH2Q76I76 1423 aa14.92□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 LRP5O75197 1615 aa14.92□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.92□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.91□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 USP19O94966 1318 aa14.91□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.9□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 NLRP13Q86W25 1043 aa14.9□□□□□ -0.02
CLRN3-201ENST00000368671 CPDO75976 1380 aa14.89□□□□□ -0.03
CLRN3-201ENST00000368671 TRIM37O94972 964 aa14.89□□□□□ -0.03
CLRN3-201ENST00000368671 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLRN3-201ENST00000368671 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.89□□□□□ -0.03
CLRN3-201ENST00000368671 GCP02774 474 aa14.88□□□□□ -0.03
CLRN3-201ENST00000368671 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms