RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 STK26Q9P289 416 aa23.85■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.84■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.84■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CITED2-201ENST00000367651 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.83■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.81■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.81■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 FYB1O15117 783 aa23.8■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.8■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.8■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.79■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 SMC5Q8IY18 1101 aa23.79■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 IDI1Q13907 227 aa23.79■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 RIPK4P57078 832 aa23.78■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.78■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 PTPRMP28827 1452 aa23.78■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.78■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 ARXQ96QS3 562 aa23.77■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 RAPGEF3O95398 923 aa23.77■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 MCM4P33991 863 aa23.77■■□□□ 1.4
CITED2-201ENST00000367651 IL16Q14005 1332 aa23.75■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 PRAM1Q96QH2 718 aa23.73■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.73■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.72■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 MED14O60244 1454 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 FBLN1P23142 703 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 LNPKQ9C0E8 428 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.71■■□□□ 1.39
CITED2-201ENST00000367651 NUCB1Q02818 461 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 ZFYVE9O95405 1425 aa23.7■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 FSD2A1L4K1 749 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 KIF16BQ96L93 1317 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 PANK2Q9BZ23 570 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.67■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.66■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.66■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.66■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 HSCBQ8IWL3 235 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 TRAK2O60296 914 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 PRKAR2BP31323 418 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 DDIT3P35638 169 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.64■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.64■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.64■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.64■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.64■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 CABP1Q9NZU7 370 aa23.64■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.64■■□□□ 1.38
CITED2-201ENST00000367651 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.63■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 CDK19Q9BWU1 502 aa23.63■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.63■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.63■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.62■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 NEO1Q92859 1461 aa23.62■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.61■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 TSPYL6Q8N831 410 aa23.61■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.61■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.61■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 FCHSD2O94868 740 aa23.6■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 KIF2CQ99661 725 aa23.6■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 POLKQ9UBT6 870 aa23.6■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 HMOX1P09601 288 aa23.59■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 ALKQ9UM73 1620 aa23.58■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 VAMP4O75379 141 aa23.58■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 SNX21Q969T3 373 aa23.58■■□□□ 1.37
CITED2-201ENST00000367651 RICTORQ6R327 1708 aa23.57■■□□□ 1.36
CITED2-201ENST00000367651 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.57■■□□□ 1.36
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.57■■□□□ 1.36
CITED2-201ENST00000367651 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms