RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362813.1

RN7SKP185-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 185, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP185, Length 326 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP185-201ENST00000362813 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.18□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 MON2Q7Z3U7 1717 aa7.18□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.18□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 IDI1Q13907 227 aa7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 ZNF428Q96B54 188 aa7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 PPP6R1Q9UPN7 881 aa7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 KIF16BQ96L93 1317 aa7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 DIP2BQ9P265 1576 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 ITSN1Q15811 1721 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 AKAP12Q02952 1782 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 RLBP1P12271 317 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 CABP2Q9NPB3 220 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 CPS1P31327 1500 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.16□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 NEUROD2Q15784 382 aa7.15□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.15□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 PIK3R4Q99570 1358 aa7.15□□□□□ -1.26
RN7SKP185-201ENST00000362813 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.15□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 FYB1O15117 783 aa7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 FCHSD2O94868 740 aa7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 RAPGEF3O95398 923 aa7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 C3P01024 1663 aa7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 SLC4A3P48751 1232 aa7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 PTCH1Q13635 1447 aa7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 SMC5Q8IY18 1101 aa7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.14□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 TECPR2O15040 1411 aa7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 PRAM1Q96QH2 718 aa7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 POGKQ9P215 609 aa7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 TNNQ9UQP3 1299 aa7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.12□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 SEC24BO95487 1268 aa7.12□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 TRIM27P14373 513 aa7.12□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.12□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 ARHGAP45Q92619 1136 aa7.12□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.12□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.12□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 RIPK4P57078 832 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 SIRT1Q96EB6 747 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 CDK19Q9BWU1 502 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 STK26Q9P289 416 aa7.11□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.1□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 NFE2L2Q16236 605 aa7.1□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.1□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.1□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 GNAI1P63096 354 aa7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 NUCB1Q02818 461 aa7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 GCC1Q96CN9 775 aa7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 IFT57Q9NWB7 429 aa7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 RGPD1P0DJD0 1748 aa7.09□□□□□ -1.27
RN7SKP185-201ENST00000362813 ABCC4O15439 1325 aa7.08□□□□□ -1.28
RN7SKP185-201ENST00000362813 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms