RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.39■■□□□ 1.5
SNX11-201ENST00000359238 USP35Q9P2H5 1018 aa24.39■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.39■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 ATP7BP35670 1465 aa24.38■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.38■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 PIK3R4Q99570 1358 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 ADGRB2O60241 1585 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.37■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.36■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 NSD2O96028 1365 aa24.36■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 APAF1O14727 1248 aa24.35■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SNX11-201ENST00000359238 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.32■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 ZNF521Q96K83 1311 aa24.32■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 NME9Q86XW9 330 aa24.32■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.31■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 HSPA2P54652 639 aa24.3■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 AKAP12Q02952 1782 aa24.3■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.3■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.28■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 ITSN1Q15811 1721 aa24.27■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SNX11-201ENST00000359238 PDE3BQ13370 1112 aa24.26■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 NEFMP07197 916 aa24.25■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.24■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 ACEP12821 1306 aa24.24■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 NEUROD2Q15784 382 aa24.23■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.22■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.22■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.21■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 POLKQ9UBT6 870 aa24.21■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.2■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.2■■□□□ 1.47
SNX11-201ENST00000359238 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 CFAP53Q96M91 514 aa24.2■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.2■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.2■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.19■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 GOLGA2Q08379 1002 aa24.18■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 PLIN1O60240 522 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 C14orf37Q86TY3 774 aa24.17■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 SLFN5Q08AF3 891 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 RUNDC1Q96C34 613 aa24.16■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 USP6P35125 1406 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 MS4A1P11836 297 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 PDE4AP27815 886 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 WWC1Q8IX03 1113 aa24.15■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.14■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.14■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.14■■□□□ 1.46
SNX11-201ENST00000359238 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 NWD1Q149M9 1564 aa24.13■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.13■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 COG3Q96JB2 828 aa24.12■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 BACH2Q9BYV9 841 aa24.12■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.12■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 SSH2Q76I76 1423 aa24.09■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SNX11-201ENST00000359238 SOX12O15370 315 aa24.07■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.06■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.05■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 HMOX1P09601 288 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 GSE1Q14687 1217 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.04■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 PEAK1Q9H792 1746 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.03■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 PIK3C2AO00443 1686 aa24.02■■□□□ 1.44
SNX11-201ENST00000359238 TMEM94Q12767 1356 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms