RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 IL27Q8NEV9 243 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 STK26Q9P289 416 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 FYB1O15117 783 aa23.21■■□□□ 1.31
SPNS3-201ENST00000355530 PRAM1Q96QH2 718 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 ALKQ9UM73 1620 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM27P14373 513 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 POGKQ9P215 609 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 KIF16BQ96L93 1317 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS3-201ENST00000355530 DLC1Q96QB1 1528 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 RIPK4P57078 832 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 ATP7BP35670 1465 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 CDK19Q9BWU1 502 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 SMC5Q8IY18 1101 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 FCHSD2O94868 740 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF428Q96B54 188 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 CABP1Q9NZU7 370 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 REREQ9P2R6 1566 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 PRKAR2BP31323 418 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 AGLP35573 1532 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 POLKQ9UBT6 870 aa23■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 NUCB1Q02818 461 aa23■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 PTCH1Q13635 1447 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 NFE2L2Q16236 605 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 PIK3R4Q99570 1358 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.95■■□□□ 1.27
SPNS3-201ENST00000355530 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 IFT57Q9NWB7 429 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 GNAI1P63096 354 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 HSCBQ8IWL3 235 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 VAMP4O75379 141 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS3-201ENST00000355530 GCC1Q96CN9 775 aa22.91■■□□□ 1.26
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