RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 INSRP06213 1382 aa19.01■□□□□ 0.63
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PTPRU-201ENST00000345512 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
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PTPRU-201ENST00000345512 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa18.93■□□□□ 0.62
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PTPRU-201ENST00000345512 IL16Q14005 1332 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 IFT57Q9NWB7 429 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 FYB1O15117 783 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 GNAI2P04899 355 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 GNAI3P08754 354 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.86■□□□□ 0.61
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PTPRU-201ENST00000345512 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 MCM2P49736 904 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 SMC5Q8IY18 1101 aa18.86■□□□□ 0.61
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PTPRU-201ENST00000345512 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
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PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 TEFQ10587 303 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 NME9Q86XW9 330 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 MPNDQ8N594 471 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRU-201ENST00000345512 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRU-201ENST00000345512 MCM10Q7L590 875 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRU-201ENST00000345512 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.82■□□□□ 0.6
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