RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 ACEP12821 1306 aa21.45■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 APAF1O14727 1248 aa21.44■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 GOLGA2Q08379 1002 aa21.44■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 COG3Q96JB2 828 aa21.44■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 USP6P35125 1406 aa21.43■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.43■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.43■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 SSH2Q76I76 1423 aa21.42■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 TTC21AQ8NDW8 1320 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.41■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 CCDC27Q2M243 656 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 NME9Q86XW9 330 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 POLKQ9UBT6 870 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 NWD1Q149M9 1564 aa21.4■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HPS1-202ENST00000338546 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 SLFN5Q08AF3 891 aa21.38■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 E9PSI1 815 aa21.37■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.37■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.36■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.36■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.36■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.36■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.36■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.35■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 USP31Q70CQ4 1352 aa21.35■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 WDR63Q8IWG1 891 aa21.34■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 WWC1Q8IX03 1113 aa21.34■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 NUTM2FA1L443 756 aa21.33■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 FCHSD2O94868 740 aa21.33■■□□□ 1.01
HPS1-202ENST00000338546 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.32■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.31■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.3■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.29■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 USP54Q70EL1 1684 aa21.28■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.28■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 IL13P35225 146 aa21.27■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.27■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.27■■□□□ 1
HPS1-202ENST00000338546 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.26■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 NEFMP07197 916 aa21.25■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.24■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 FBLN1P23142 703 aa21.23■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.23■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 IL16Q14005 1332 aa21.23■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 PIK3C2AO00443 1686 aa21.22■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.21■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
HPS1-202ENST00000338546 NEUROD2Q15784 382 aa21.2■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.2■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 C14orf37Q86TY3 774 aa21.19■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.19■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 SBNO1A3KN83 1393 aa21.18■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 DCCP43146 1447 aa21.18■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 PRKAR2BP31323 418 aa21.18■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.17■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.17■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 FLT4P35916 1363 aa21.17■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 RIPK4P57078 832 aa21.16■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 NLRP6P59044 892 aa21.16■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.15■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 KIF1AQ12756 1690 aa21.15■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 PEAK1Q9H792 1746 aa21.15■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 NFE2L2Q16236 605 aa21.14■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 ABTB2Q8N961 1025 aa21.14■□□□□ 0.98
HPS1-202ENST00000338546 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.14■□□□□ 0.97
HPS1-202ENST00000338546 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HPS1-202ENST00000338546 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
HPS1-202ENST00000338546 PSME1Q06323 249 aa21.14■□□□□ 0.97
HPS1-202ENST00000338546 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.13■□□□□ 0.97
HPS1-202ENST00000338546 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
HPS1-202ENST00000338546 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.12■□□□□ 0.97
HPS1-202ENST00000338546 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.12■□□□□ 0.97
HPS1-202ENST00000338546 ARHGEF10O15013 1369 aa21.12■□□□□ 0.97
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