RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.89□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.89□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 EID1Q9Y6B2 187 aa14.89□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 PTCH1Q13635 1447 aa14.88□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.88□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.88□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 WDR63Q8IWG1 891 aa14.88□□□□□ -0.03
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PGA3-201ENST00000325558 ITSN1Q15811 1721 aa14.87□□□□□ -0.03
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PGA3-201ENST00000325558 POLKQ9UBT6 870 aa14.86□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.86□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 SSH2Q76I76 1423 aa14.85□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.85□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 PIK3R4Q99570 1358 aa14.85□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 PLIN1O60240 522 aa14.84□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.84□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.83□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
PGA3-201ENST00000325558 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.82□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 NME9Q86XW9 330 aa14.81□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 CRBNQ96SW2 442 aa14.81□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.8□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.8□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 FCHSD2O94868 740 aa14.8□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 FBLN1P23142 703 aa14.8□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 IL13P35225 146 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 USP6P35125 1406 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.79□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 ACEP12821 1306 aa14.78□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 USP31Q70CQ4 1352 aa14.78□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.78□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 IL16Q14005 1332 aa14.77□□□□□ -0.04
PGA3-201ENST00000325558 BCAR3O75815 825 aa14.77□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.76□□□□□ -0.05
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PGA3-201ENST00000325558 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.75□□□□□ -0.05
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PGA3-201ENST00000325558 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
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PGA3-201ENST00000325558 NEUROD2Q15784 382 aa14.75□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 COG3Q96JB2 828 aa14.75□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.75□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.74□□□□□ -0.05
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PGA3-201ENST00000325558 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.73□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 USP54Q70EL1 1684 aa14.73□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.72□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.72□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.72□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 PEAK1Q9H792 1746 aa14.71□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.71□□□□□ -0.05
PGA3-201ENST00000325558 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.7□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.69□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.69□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 PRKAR2BP31323 418 aa14.69□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 RIPK4P57078 832 aa14.69□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 PIK3C2AO00443 1686 aa14.68□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.68□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 NFE2L2Q16236 605 aa14.68□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 NUTM2FA1L443 756 aa14.67□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 ZNF853P0CG23 659 aa14.66□□□□□ -0.06
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PGA3-201ENST00000325558 MS4A1P11836 297 aa14.65□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 AAMPQ13685 434 aa14.65□□□□□ -0.06
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PGA3-201ENST00000325558 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.65□□□□□ -0.06
PGA3-201ENST00000325558 HMOX1P09601 288 aa14.64□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 NWD1Q149M9 1564 aa14.64□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PGA3-201ENST00000325558 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.62□□□□□ -0.07
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