RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.92□□□□□ -0.66
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.92□□□□□ -0.66
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.92□□□□□ -0.66
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HSPA1LP34931 641 aa10.91□□□□□ -0.66
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POGKQ9P215 609 aa10.91□□□□□ -0.66
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.91□□□□□ -0.66
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.91□□□□□ -0.66
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BRINP3Q76B58 766 aa10.91□□□□□ -0.66
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.88□□□□□ -0.67
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ORAI2Q96SN7 254 aa10.88□□□□□ -0.67
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CARD11Q9BXL7 1154 aa10.86□□□□□ -0.67
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.85□□□□□ -0.67
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.84□□□□□ -0.67
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.84□□□□□ -0.67
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.83□□□□□ -0.68
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USP32Q8NFA0 1604 aa10.83□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.82□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CDK19Q9BWU1 502 aa10.82□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.82□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SNPHO15079 494 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FOXO3O43524 673 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SEC24BO95487 1268 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PHLPP1O60346 1717 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ATP7BP35670 1465 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SLC24A1O60721 1099 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.81□□□□□ -0.68
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.8□□□□□ -0.68
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.8□□□□□ -0.68
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.79□□□□□ -0.68
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EVC2Q86UK5 1308 aa10.78□□□□□ -0.68
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.76□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.75□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PSME1Q06323 249 aa10.74□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.74□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.74□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SHPRHQ149N8 1683 aa10.74□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa10.74□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CABP1Q9NZU7 370 aa10.74□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ACEP12821 1306 aa10.74□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ITSN1Q15811 1721 aa10.74□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SBNO1A3KN83 1393 aa10.73□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ATAD2Q6PL18 1390 aa10.73□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LRP6O75581 1613 aa10.72□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.72□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.72□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TIE1P35590 1138 aa10.71□□□□□ -0.69
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.7□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.7□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TMF1P82094 1093 aa10.7□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IER5LQ5T953 404 aa10.7□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ARHGEF10O15013 1369 aa10.69□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USP6P35125 1406 aa10.69□□□□□ -0.7
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
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