RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.99■■■■□ 3.51
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RP9-201ENST00000297157 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.9■■■■□ 3.5
RP9-201ENST00000297157 BTG4Q9NY30 223 aa36.9■■■■□ 3.5
RP9-201ENST00000297157 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.89■■■■□ 3.5
RP9-201ENST00000297157 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.89■■■■□ 3.5
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RP9-201ENST00000297157 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.81■■■■□ 3.48
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RP9-201ENST00000297157 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.67■■■■□ 3.46
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RP9-201ENST00000297157 FAM182BQ5T319 152 aa36.59■■■■□ 3.45
RP9-201ENST00000297157 SSH2Q76I76 1423 aa36.59■■■■□ 3.45
RP9-201ENST00000297157 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.58■■■■□ 3.45
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RP9-201ENST00000297157 STRN4Q9NRL3 753 aa36.56■■■■□ 3.44
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RP9-201ENST00000297157 EVA1CP58658 441 aa36.45■■■■□ 3.43
RP9-201ENST00000297157 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
RP9-201ENST00000297157 USP35Q9P2H5 1018 aa36.44■■■■□ 3.42
RP9-201ENST00000297157 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.42■■■■□ 3.42
RP9-201ENST00000297157 CABP1Q9NZU7 370 aa36.42■■■■□ 3.42
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RP9-201ENST00000297157 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.27■■■■□ 3.4
RP9-201ENST00000297157 LRRC37A3O60309 1634 aa36.26■■■■□ 3.4
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RP9-201ENST00000297157 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
RP9-201ENST00000297157 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa36.23■■■■□ 3.39
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