RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
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PTPRN-201ENST00000295718 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.43
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PTPRN-201ENST00000295718 ERC2O15083 957 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRN-201ENST00000295718 PLA2R1Q13018 1463 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRN-201ENST00000295718 PHF14O94880 888 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRN-201ENST00000295718 FOSBP53539 338 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRN-201ENST00000295718 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRN-201ENST00000295718 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
PTPRN-201ENST00000295718 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRN-201ENST00000295718 CBX1P83916 185 aa17.56■□□□□ 0.4
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