RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.96□□□□□ -0.17
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PTPRR-201ENST00000283228 GCC1Q96CN9 775 aa13.82□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 CCDC27Q2M243 656 aa13.81□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
PTPRR-201ENST00000283228 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.8□□□□□ -0.2
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