RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281623.7

FBXO4-201, Transcript of F-box protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FBXO4, Length 1,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4-201ENST00000281623 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.45■■□□□ 1.18
FBXO4-201ENST00000281623 A0A1W2PP64 1363 aa22.45■■□□□ 1.18
FBXO4-201ENST00000281623 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
FBXO4-201ENST00000281623 NSD2O96028 1365 aa22.43■■□□□ 1.18
FBXO4-201ENST00000281623 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
FBXO4-201ENST00000281623 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.42■■□□□ 1.18
FBXO4-201ENST00000281623 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
FBXO4-201ENST00000281623 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
FBXO4-201ENST00000281623 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.39■■□□□ 1.18
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.39■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.38■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.37■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.37■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.37■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 MORC1Q86VD1 984 aa22.36■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 AKAP12Q02952 1782 aa22.35■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.35■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 PXDNQ92626 1479 aa22.35■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 FOXO3O43524 673 aa22.34■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 CABP1Q9NZU7 370 aa22.33■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
FBXO4-201ENST00000281623 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.32■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 SHPRHQ149N8 1683 aa22.31■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.31■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.31■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.29■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 ACEP12821 1306 aa22.28■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 PSME1Q06323 249 aa22.27■■□□□ 1.16
FBXO4-201ENST00000281623 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.26■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.26■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 NUDCQ9Y266 331 aa22.26■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 ALS2Q96Q42 1657 aa22.26■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 FYB1O15117 783 aa22.26■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 JCADQ9P266 1359 aa22.25■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 NEFLP07196 543 aa22.24■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.24■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.23■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 SBNO1A3KN83 1393 aa22.23■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.23■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 FKBP8Q14318 412 aa22.23■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 USP6P35125 1406 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 MTHFSP49914 203 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 PDE3BQ13370 1112 aa22.2■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
FBXO4-201ENST00000281623 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.2■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 ABCA3Q99758 1704 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 ARHGEF10O15013 1369 aa22.18■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 CFAP53Q96M91 514 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 LRP6O75581 1613 aa22.17■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 SSH2Q76I76 1423 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 PIK3C2AO00443 1686 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.16■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.14■■□□□ 1.14
FBXO4-201ENST00000281623 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.13■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 ZNF521Q96K83 1311 aa22.13■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 USP54Q70EL1 1684 aa22.11■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.11■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.11■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.1■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 NME9Q86XW9 330 aa22.1■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 ABTB2Q8N961 1025 aa22.09■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 NGEFQ8N5V2 710 aa22.08■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.08■■□□□ 1.13
FBXO4-201ENST00000281623 APAF1O14727 1248 aa22.07■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.06■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.06■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.05■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.04■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 RUNDC1Q96C34 613 aa22.04■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 POLKQ9UBT6 870 aa22.04■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.04■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.03■■□□□ 1.12
FBXO4-201ENST00000281623 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.03■■□□□ 1.12
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