RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.72□□□□□ -0.05
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PTPRS-201ENST00000262963 KIAA0556O60303 1618 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRS-201ENST00000262963 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 NFKBIBQ15653 356 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.71□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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PTPRS-201ENST00000262963 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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PTPRS-201ENST00000262963 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
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PTPRS-201ENST00000262963 VPS37DQ86XT2 251 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.69□□□□□ -0.06
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PTPRS-201ENST00000262963 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
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PTPRS-201ENST00000262963 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.68□□□□□ -0.06
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PTPRS-201ENST00000262963 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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PTPRS-201ENST00000262963 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 MSH5O43196 834 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 DISP1Q96F81 1524 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 TESK2Q96S53 571 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 CEP89Q96ST8 783 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 BICD2Q8TD16 824 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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PTPRS-201ENST00000262963 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRS-201ENST00000262963 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRS-201ENST00000262963 ERICH2A1L162 156 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTPRS-201ENST00000262963 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 SLC4A2P04920 1241 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 TPM2P07951 284 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 ARID3AQ99856 593 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 PZPP20742 1482 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.63□□□□□ -0.07
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PTPRS-201ENST00000262963 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 CNTROBQ8N137 903 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 NFE2L2Q16236 605 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 WASHC4Q2M389 1173 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.61□□□□□ -0.07
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PTPRS-201ENST00000262963 NME9Q86XW9 330 aa14.61□□□□□ -0.07
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PTPRS-201ENST00000262963 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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PTPRS-201ENST00000262963 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRS-201ENST00000262963 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 DCTN1Q14203 1278 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRS-201ENST00000262963 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 MCM2P49736 904 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRS-201ENST00000262963 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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