RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258428.7

REV1-201, Transcript of REV1, DNA directed polymerase, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene REV1, Length 4,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1-201ENST00000258428 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
REV1-201ENST00000258428 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
REV1-201ENST00000258428 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
REV1-201ENST00000258428 SPG7Q9UQ90 795 aa25.33■■□□□ 1.65
REV1-201ENST00000258428 CABP4P57796 275 aa25.33■■□□□ 1.65
REV1-201ENST00000258428 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 PLCH2O75038 1416 aa25.32■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.32■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 NOS1P29475 1434 aa25.32■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.32■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.32■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 TRDNQ13061 729 aa25.32■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 FAM177BA6PVY3 158 aa25.31■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.31■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 ASXL2Q76L83 1435 aa25.31■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.31■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 NME9Q86XW9 330 aa25.3■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.3■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.3■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 NFE2L2Q16236 605 aa25.3■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.3■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 TPM4P67936 248 aa25.29■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 GNAI2P04899 355 aa25.29■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 WWC1Q8IX03 1113 aa25.29■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 MARCH6O60337 910 aa25.29■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 CDC45O75419 566 aa25.28■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 MCTP1Q6DN14 999 aa25.28■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 CPLX1O14810 134 aa25.28■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.28■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 FOXO3O43524 673 aa25.27■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 PTPRKQ15262 1439 aa25.27■■□□□ 1.64
REV1-201ENST00000258428 PHF14O94880 888 aa25.26■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.26■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.26■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.26■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 WASHC4Q2M389 1173 aa25.26■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.26■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.25■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 FBXW7Q969H0 707 aa25.23■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 GCC1Q96CN9 775 aa25.23■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.23■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 VPS53Q5VIR6 699 aa25.23■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 SLFN5Q08AF3 891 aa25.22■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 FSD1Q9BTV5 496 aa25.22■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.22■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.22■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 ZNF428Q96B54 188 aa25.22■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 CNTROBQ8N137 903 aa25.21■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 PIP4K2BP78356 416 aa25.21■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 RAD21O60216 631 aa25.21■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.21■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 BTBD11A6QL63 1104 aa25.2■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 MYL6BP14649 208 aa25.2■■□□□ 1.63
REV1-201ENST00000258428 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.2■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.2■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 TRIM29Q14134 588 aa25.19■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.19■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 MCM10Q7L590 875 aa25.18■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.17■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.17■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 DCTN1Q14203 1278 aa25.17■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.17■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.16■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.16■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 CCDC27Q2M243 656 aa25.15■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 A2MP01023 1474 aa25.15■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 ERICH2A1L162 156 aa25.15■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.15■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 ADAMTS12P58397 1594 aa25.15■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.14■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 TNRQ92752 1358 aa25.14■■□□□ 1.62
REV1-201ENST00000258428 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.14■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 KLHL34Q8N239 644 aa25.13■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.12■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.12■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.12■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 SIL1Q9H173 461 aa25.12■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.12■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 NUCB2P80303 420 aa25.11■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.11■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.11■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.11■■□□□ 1.61
REV1-201ENST00000258428 KIAA0556O60303 1618 aa25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms