RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 PTPRUQ92729 1446 aa22.28■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.28■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.28■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.27■■□□□ 1.16
FCHO1-201ENST00000252771 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.26■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.26■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC27Q2M243 656 aa22.26■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 BCAR3O75815 825 aa22.26■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.25■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 POLKQ9UBT6 870 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 NME9Q86XW9 330 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 WDR63Q8IWG1 891 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 EID1Q9Y6B2 187 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 AKAP12Q02952 1782 aa22.24■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
FCHO1-201ENST00000252771 ITSN1Q15811 1721 aa22.2■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.18■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 TBX22Q9Y458 520 aa22.18■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.18■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.17■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.16■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 NUTM2FA1L443 756 aa22.16■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FCHO1-201ENST00000252771 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.14■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.13■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.13■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 ACEP12821 1306 aa22.12■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 PTCH1Q13635 1447 aa22.12■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 COG3Q96JB2 828 aa22.12■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.12■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 FCHSD2O94868 740 aa22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 DIP2AQ14689 1571 aa22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 IL13P35225 146 aa22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 RIPK4P57078 832 aa22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 SKAP1Q86WV1 359 aa22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.08■■□□□ 1.13
FCHO1-201ENST00000252771 PRKAR2BP31323 418 aa22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 USP6P35125 1406 aa22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 PDE3AQ14432 1141 aa22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 HMOX1P09601 288 aa22.06■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.06■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 MSH5O43196 834 aa22.05■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 PANK1Q8TE04 598 aa22.05■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.05■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 SSH2Q76I76 1423 aa22.05■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.04■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.04■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 KCNA6P17658 529 aa22.04■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 TNNQ9UQP3 1299 aa22.03■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.02■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 IL16Q14005 1332 aa22.02■■□□□ 1.12
FCHO1-201ENST00000252771 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 COG6Q9Y2V7 657 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 RLBP1P12271 317 aa22■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 PEAK1Q9H792 1746 aa21.98■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 PIK3R4Q99570 1358 aa21.98■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 NFE2L2Q16236 605 aa21.97■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 USP31Q70CQ4 1352 aa21.97■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 MS4A1P11836 297 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-201ENST00000252771 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FCHO1-201ENST00000252771 IGHDP01880 384 aa21.95■■□□□ 1.1
FCHO1-201ENST00000252771 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
FCHO1-201ENST00000252771 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-201ENST00000252771 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-201ENST00000252771 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-201ENST00000252771 NEFMP07197 916 aa21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-201ENST00000252771 PDE4AP27815 886 aa21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-201ENST00000252771 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.6 ms