RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
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HOXD11-201ENST00000249504 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD11-201ENST00000249504 ALS2Q96Q42 1657 aa26.89■■□□□ 1.89
HOXD11-201ENST00000249504 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1W2PP64 1363 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF10O15013 1369 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD11-201ENST00000249504 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD11-201ENST00000249504 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD11-201ENST00000249504 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXD11-201ENST00000249504 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 SSH2Q76I76 1423 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 ABTB2Q8N961 1025 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHG5O94827 1062 aa26.8■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 PANK3Q9H999 370 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.78■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 PIK3C2AO00443 1686 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 ABCA3Q99758 1704 aa26.76■■□□□ 1.88
HOXD11-201ENST00000249504 LRP6O75581 1613 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 NLRP13Q86W25 1043 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 NLRP6P59044 892 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 NME9Q86XW9 330 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTS2O95450 1211 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXD11-201ENST00000249504 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXD11-201ENST00000249504 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXD11-201ENST00000249504 USP19O94966 1318 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXD11-201ENST00000249504 USP54Q70EL1 1684 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXD11-201ENST00000249504 USP31Q70CQ4 1352 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD11-201ENST00000249504 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD11-201ENST00000249504 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD11-201ENST00000249504 SLIT3O75094 1523 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD11-201ENST00000249504 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.64■■□□□ 1.85
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HOXD11-201ENST00000249504 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.62■■□□□ 1.85
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HOXD11-201ENST00000249504 C8orf37Q96NL8 207 aa26.62■■□□□ 1.85
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HOXD11-201ENST00000249504 SOX12O15370 315 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD11-201ENST00000249504 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD11-201ENST00000249504 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD11-201ENST00000249504 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD11-201ENST00000249504 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
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HOXD11-201ENST00000249504 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA0232Q92628 1395 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD11-201ENST00000249504 NSD2O96028 1365 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD11-201ENST00000249504 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXD11-201ENST00000249504 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD11-201ENST00000249504 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD11-201ENST00000249504 NFAT5O94916 1531 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD11-201ENST00000249504 AFF2P51816 1311 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD11-201ENST00000249504 CPDO75976 1380 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD11-201ENST00000249504 FAM83GA6ND36 823 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 CHRNA2Q15822 529 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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HOXD11-201ENST00000249504 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 SLIT2O94813 1529 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 USP21Q9UK80 565 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.46■■□□□ 1.83
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HOXD11-201ENST00000249504 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 BTG4Q9NY30 223 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD11-201ENST00000249504 MORC1Q86VD1 984 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 ANP32CO43423 234 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 NRAPQ86VF7 1730 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 COL18A1P39060 1754 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXD11-201ENST00000249504 ABCC6O95255 1503 aa26.42■■□□□ 1.82
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