RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
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CITED1-201ENST00000246139 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.91■■■□□ 2.38
CITED1-201ENST00000246139 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.91■■■□□ 2.38
CITED1-201ENST00000246139 TONSLQ96HA7 1378 aa29.9■■■□□ 2.38
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CITED1-201ENST00000246139 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
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CITED1-201ENST00000246139 A0A0G2JS52 829 aa29.7■■■□□ 2.35
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CITED1-201ENST00000246139 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.67■■■□□ 2.34
CITED1-201ENST00000246139 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.67■■■□□ 2.34
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CITED1-201ENST00000246139 NLRP6P59044 892 aa29.57■■■□□ 2.32
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CITED1-201ENST00000246139 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.56■■■□□ 2.32
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CITED1-201ENST00000246139 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
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CITED1-201ENST00000246139 USP35Q9P2H5 1018 aa29.48■■■□□ 2.31
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CITED1-201ENST00000246139 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
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CITED1-201ENST00000246139 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
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CITED1-201ENST00000246139 BARGINQ6ZT62 677 aa29.38■■■□□ 2.29
CITED1-201ENST00000246139 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.38■■■□□ 2.29
CITED1-201ENST00000246139 PIK3C2AO00443 1686 aa29.37■■■□□ 2.29
CITED1-201ENST00000246139 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.36■■■□□ 2.29
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