RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 CLTCL1P53675 1640 aa22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 NUCB2P80303 420 aa22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM27P14373 513 aa22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1-201ENST00000216420 PTPRTO14522 1441 aa22.83■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 NOS1P29475 1434 aa22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 NEUROD2Q15784 382 aa22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 FGD1P98174 961 aa22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCC11Q96J66 1382 aa22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.78■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 AK9Q5TCS8 1911 aa22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 MYOM2P54296 1465 aa22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.77■■□□□ 1.24
CGRRF1-201ENST00000216420 MCTP1Q6DN14 999 aa22.77■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 MED14O60244 1454 aa22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.76■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 RABEP1Q15276 862 aa22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 MORC1Q86VD1 984 aa22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCA6Q8N139 1617 aa22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 KIF20AO95235 890 aa22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 LNPKQ9C0E8 428 aa22.75■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.74■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 GCC1Q96CN9 775 aa22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 IL16Q14005 1332 aa22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 CFAP53Q96M91 514 aa22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 CFAP44Q96MT7 982 aa22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 ERCC6Q03468 1493 aa22.73■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.72■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 GPT2Q8TD30 523 aa22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.7■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 JPH4Q96JJ6 628 aa22.7■■□□□ 1.23
CGRRF1-201ENST00000216420 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 CDC45O75419 566 aa22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 IFT172Q9UG01 1749 aa22.69■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 TET3O43151 1660 aa22.68■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 DEPDC5O75140 1603 aa22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 MBD3O95983 291 aa22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 MTHFSP49914 203 aa22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.66■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 NSD2O96028 1365 aa22.65■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.65■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 CD109Q6YHK3 1445 aa22.65■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 PIK3R4Q99570 1358 aa22.64■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.64■■□□□ 1.22
CGRRF1-201ENST00000216420 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.62■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.62■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.61■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 SYCE3A1L190 88 aa22.61■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF428Q96B54 188 aa22.61■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.61■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 PKP1Q13835 747 aa22.6■■□□□ 1.21
CGRRF1-201ENST00000216420 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.6■■□□□ 1.21
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