RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.57■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 USP6P35125 1406 aa25.55■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.54■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 PDE3BQ13370 1112 aa25.54■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 FBLN1P23142 703 aa25.53■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 COG3Q96JB2 828 aa25.53■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.53■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 NWD1Q149M9 1564 aa25.52■■□□□ 1.68
SLC25A3-201ENST00000188376 APAF1O14727 1248 aa25.51■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 HSPA2P54652 639 aa25.51■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.51■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.5■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 POLKQ9UBT6 870 aa25.49■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.677e-9■□□□□ 8.6
SLC25A3-201ENST00000188376 C14orf37Q86TY3 774 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 SSH2Q76I76 1423 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC25A3-201ENST00000188376 RUNDC1Q96C34 613 aa25.45■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.45■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF521Q96K83 1311 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC25A3-201ENST00000188376 GOLGA2Q08379 1002 aa25.39■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.39■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 NGEFQ8N5V2 710 aa25.39■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 PIK3C2AO00443 1686 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 NEUROD2Q15784 382 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.36■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 USP31Q70CQ4 1352 aa25.34■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 STRCQ7RTU9 1775 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 SOX12O15370 315 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 WWC1Q8IX03 1113 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.33■■□□□ 1.65
SLC25A3-201ENST00000188376 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.32■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 SLFN5Q08AF3 891 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 IL13P35225 146 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.31■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 TMEM94Q12767 1356 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 NLRP6P59044 892 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 ORAI2Q96SN7 254 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 ABTB2Q8N961 1025 aa25.29■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 PEAK1Q9H792 1746 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 FCHSD2O94868 740 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 PSME1Q06323 249 aa25.27■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SLC25A3-201ENST00000188376 E9PSI1 815 aa25.26■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 HMOX1P09601 288 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 USP54Q70EL1 1684 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC27Q2M243 656 aa25.25■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 PRKAR2BP31323 418 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.24■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 FOXO3O43524 673 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 ATF3P18847 181 aa25.23■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.22■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 WDR63Q8IWG1 891 aa25.21■■□□□ 1.63
SLC25A3-201ENST00000188376 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 DCCP43146 1447 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 NEFMP07197 916 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF1AQ12756 1690 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 SBNO1A3KN83 1393 aa25.19■■□□□ 1.62
SLC25A3-201ENST00000188376 MST1RQ04912 1400 aa25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms