RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000159111.8

KDM4B-201, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDM4B, Length 5,593 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-201ENST00000159111 ARID3AQ99856 593 aa20.62■□□□□ 0.89
KDM4B-201ENST00000159111 AKNAQ7Z591 1439 aa20.62■□□□□ 0.89
KDM4B-201ENST00000159111 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
KDM4B-201ENST00000159111 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 11.4
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KDM4B-201ENST00000159111 ABCC5O15440 1437 aa20.6■□□□□ 0.89
KDM4B-201ENST00000159111 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.6■□□□□ 0.89
KDM4B-201ENST00000159111 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.6■□□□□ 0.89
KDM4B-201ENST00000159111 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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KDM4B-201ENST00000159111 FSD1Q9BTV5 496 aa20.59■□□□□ 0.89
KDM4B-201ENST00000159111 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.59■□□□□ 0.89
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KDM4B-201ENST00000159111 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.57■□□□□ 0.88
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KDM4B-201ENST00000159111 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.56■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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KDM4B-201ENST00000159111 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.54■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 MRE11P49959 708 aa20.54■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.54■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.53■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.53■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.53■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 XBP1P17861 261 aa20.52■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 GPS2Q13227 327 aa20.52■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.52■□□□□ 0.88
KDM4B-201ENST00000159111 MBD3O95983 291 aa20.52■□□□□ 0.87
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KDM4B-201ENST00000159111 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.5■□□□□ 0.87
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KDM4B-201ENST00000159111 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 FBXW7Q969H0 707 aa20.49■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.49■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 NEK4P51957 841 aa20.48■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 NFE2L2Q16236 605 aa20.48■□□□□ 0.87
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KDM4B-201ENST00000159111 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 ADGRL1O94910 1474 aa20.48■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF592Q92610 1267 aa20.48■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 CCDC27Q2M243 656 aa20.47■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.47■□□□□ 0.87
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KDM4B-201ENST00000159111 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.47■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 TRAK2O60296 914 aa20.47■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 OLFM4Q6UX06 510 aa20.47■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 FOSBP53539 338 aa20.46■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.46■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 CD109Q6YHK3 1445 aa20.46■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 CABP4P57796 275 aa20.46■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
KDM4B-201ENST00000159111 ABCC11Q96J66 1382 aa20.45■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 HOMER1Q86YM7 354 aa20.45■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 ANKRD1Q15327 319 aa20.45■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.45■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 CCDC184Q52MB2 194 aa20.45■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 NCOA1Q15788 1441 aa20.44■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.861e-6■■■□□ 17.8
KDM4B-201ENST00000159111 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
KDM4B-201ENST00000159111 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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