RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.28■■□□□ 1.16
CLDN11-201ENST00000064724 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.27■■□□□ 1.16
CLDN11-201ENST00000064724 IL16Q14005 1332 aa22.26■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 CABP1Q9NZU7 370 aa22.26■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 USP35Q9P2H5 1018 aa22.26■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.24■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 TNNQ9UQP3 1299 aa22.23■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 ATP7BP35670 1465 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 ZMYM3Q14202 1370 aa22.22■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CLDN11-201ENST00000064724 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.2■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 FCHSD2O94868 740 aa22.19■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.19■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 BCL11AQ9H165 835 aa22.19■■□□□ 1.14
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CLDN11-201ENST00000064724 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 RIPK4P57078 832 aa22.18■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 NEFMP07197 916 aa22.16■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 POLKQ9UBT6 870 aa22.16■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 USP19O94966 1318 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 TSPOAP1O95153 1857 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.15■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CLDN11-201ENST00000064724 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.14■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 TRIM27P14373 513 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 SIRT1Q96EB6 747 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.13■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.12■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.12■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.12■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 SLC4A3P48751 1232 aa22.12■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.11■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 METP08581 1390 aa22.11■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.1■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 MLECQ14165 292 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 TECPR2O15040 1411 aa22.09■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 SEC24BO95487 1268 aa22.08■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 PRKAR2BP31323 418 aa22.08■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.08■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.08■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.08■■□□□ 1.13
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF428Q96B54 188 aa22.08■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 KIF16BQ96L93 1317 aa22.07■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 FBLN1P23142 703 aa22.06■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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CLDN11-201ENST00000064724 IL13P35225 146 aa22.05■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 NFE2L2Q16236 605 aa22.05■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.05■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 NFKBIBQ15653 356 aa22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 NME9Q86XW9 330 aa22.04■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.03■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.01■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 CPS1P31327 1500 aa22.01■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 SMC5Q8IY18 1101 aa22■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 TNRQ92752 1358 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 HMOX1P09601 288 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 COG3Q96JB2 828 aa21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF853P0CG23 659 aa21.98■■□□□ 1.11
CLDN11-201ENST00000064724 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
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