RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641106.1

CASC19-211, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,184 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-211ENST00000641106 BIRC3Q13489 604 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 TRPC3Q13507 836 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 MAP7Q14244 749 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 EMC10Q5UCC4 262 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 ACOT1Q86TX2 421 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CEP57L1Q8IYX8 460 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 NUP93Q8N1F7 819 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 FBXO32Q969P5 355 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 EXOC1Q9NV70 894 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 OSER1Q9NX31 292 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 EBF1Q9UH73 591 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CFAP45Q9UL16 551 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 INVSQ9Y283 1065 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 FRYLO94915 3013 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 THADAQ6YHU6 1953 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 A0A1W2PQU0 124 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SGK1O00141 431 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 TRIM24O15164 1050 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 DNAJA2O60884 412 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 KATNA1O75449 491 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 RHOBTB3O94955 611 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 APBB3O95704 486 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 HLA-DRAP01903 254 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 TRIM49P0CI25 452 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 TRIM49CP0CI26 452 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SDHBP21912 280 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CMA1P23946 247 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 GNALP38405 381 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 MPLP40238 635 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 PDE6CP51160 858 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 AP3M2P53677 418 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 AMPD2Q01433 879 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 KDSRQ06136 332 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 INCA1Q0VD86 236 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 POU4F3Q15319 338 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 PPM1JQ5JR12 505 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 AHI1Q8N157 1196 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CCDC33Q8N5R6 958 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 ALLCQ8N6M5 410 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 FRMD1Q8N878 549 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 C12orf29Q8N999 325 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 IL17RCQ8NAC3 791 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 OLIG1Q8TAK6 271 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 GOLGA5Q8TBA6 731 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 TTC9Q92623 222 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 LOXL4Q96JB6 756 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 MED10Q9BTT4 135 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 NMUR1Q9HB89 426 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CD248Q9HCU0 757 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 E2F8A0AVK6 867 aa7.53□□□□□ -1.2
CASC19-211ENST00000641106 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms