RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	HLA-F	P30511	346 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CD70	P32970	193 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	VAV2	P52735	878 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	GYS2	P54840	703 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SEC13	P55735	322 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PRKCQ	Q04759	706 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	EMC10	Q5UCC4	262 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	NETO2	Q8NC67	525 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PJA1	Q8NG27	643 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CD101	Q93033	1021 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	HCN2	Q9UL51	889 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	USP18	Q9UMW8	372 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	DMD	P11532	3685 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	USP34	Q70CQ2	3546 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MTA2	O94776	668 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	LRIG2	O94898	1065 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SCAP	Q12770	1279 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	NR1H3	Q13133	447 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CCIN	Q13939	588 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	GAS6	Q14393	721 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM215	Q68D42	235 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	HSPH1	Q92598	858 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	NTAN1	Q96AB6	310 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634		K7EQS6	105 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF8	O76064	485 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	KAT7	O95251	611 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CYBB	P04839	570 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CD48	P09326	243 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	RARA	P10276	462 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CHRNB1	P11230	501 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TNNT1	P13805	278 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	DGKG	P49619	791 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	SEMA3B	Q13214	749 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LMLN	Q96KR4	655 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PNKP	Q96T60	521 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	DEC1	Q9P2X7	70 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PJA2	O43164	708 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	RNF40	O75150	1001 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MOCS3	O95396	460 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	GOT1	P17174	413 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	COMT	P21964	271 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms