RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	GPR78	Q96P69	363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	TSPAN4	O14817	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	CD4	P01730	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	AKR1A1	P14550	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	PRKCH	P24723	683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	MAN1A1	P33908	653 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	PLA2G5	P39877	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	GDF5	P43026	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	MVD	P53602	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	NR1H2	P55055	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	DPT	Q07507	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EP300-208	ENST00000635538	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	CYR61	O00622	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	DSCR3	O14972	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	HBP1	O60381	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	PEPD	P12955	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	GSTM2	P28161	218 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	STAT1	P42224	750 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SHC2	P98077	582 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	NFIL3	Q16649	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538		Q8N1X5	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	KAT2B	Q92831	832 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538		A0A087X0M5	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538		A0A1B0GX30	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	SYN3	O14994	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ARSA	P15289	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	PROZ	P22891	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	GJC1	P36383	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	ACVRL1	P37023	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	CASP6	P55212	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EP300-208	ENST00000635538	GALNT2	Q10471	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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