RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PPC4	97 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	FAM170A	A1A519	330 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	PSMA7	O14818	248 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	IRAK2	O43187	625 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TNFSF14	O43557	240 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	GRK6	P43250	576 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	GPD2	P43304	727 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	METAP1	P53582	386 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	STIM1	Q13586	685 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TAF5	Q15542	800 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	FBXO21	O94952	628 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	IL1B	P01584	269 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TACR2	P21452	398 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	BMP6	P22004	513 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	ECT2L	Q008S8	904 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	APBA1	Q02410	837 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	BNIP3	Q12983	259 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	SHB	Q15464	509 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TTI2	Q6NXR4	508 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	EID2	Q8N6I1	236 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	PTPRN2	Q92932	1015 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	FBRS	Q9HAH7	460 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TCF4-262	ENST00000628078	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1B0GTQ1	180 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC72	A6NJI9	287 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078		E5RJQ4	531 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	VILL	O15195	856 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	THAP12	O43422	761 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	BNIP3L	O60238	219 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	GRAP2	O75791	330 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	DKK1	O94907	266 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	MOCS3	O95396	460 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	APOE	P02649	317 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ASL	P04424	464 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ITGAV	P06756	1048 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ABCB4	P21439	1286 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	GGCX	P38435	758 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	USP8	P40818	1118 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CETN1	Q12798	172 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	STIL	Q15468	1287 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ACCSL	Q4AC99	568 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	USP30	Q70CQ3	517 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SERAC1	Q96JX3	654 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TCF4-262	ENST00000628078	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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