RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 TAC4Q86UU9 113 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT15Q8N3T1 639 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 NEUROG2Q9H2A3 272 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 DKK4Q9UBT3 224 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PP55 124 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 TTC34A8MYJ7 566 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 C10orf142B7Z368 130 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ACADSBP45954 432 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 C21orf59P57076 290 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL10Q6JEL2 608 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 MARCH9Q86YJ5 346 aa25.79■■□□□ 1.72
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A18Q96N87 628 aa25.79■■□□□ 1.72
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC4A5Q9BY07 1137 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 EBF2Q9HAK2 575 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 FZD4Q9ULV1 537 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GTQ1 180 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC72A6NJI9 287 aa25.78■■□□□ 1.72
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PTPRF-216ENST00000617451 MOCS3O95396 460 aa25.78■■□□□ 1.72
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC8A1P32418 973 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 ECT2LQ008S8 904 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 IL9RQ01113 521 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 KCNH2Q12809 1159 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 DENND1BQ6P3S1 775 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 LGI2Q8N0V4 545 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 OR2T34Q8NGX1 318 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 FAM129BQ96TA1 746 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 OMDQ99983 421 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 RAXQ9Y2V3 346 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 IGSF10Q6WRI0 2623 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN9O14815 690 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ12Q14500 433 aa25.77■■□□□ 1.72
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PTPRF-216ENST00000617451 INAVAQ3KP66 663 aa25.77■■□□□ 1.72
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PTPRF-216ENST00000617451 RAP1GAP2Q684P5 730 aa25.77■■□□□ 1.72
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PTPRF-216ENST00000617451 NELFBQ8WX92 580 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 KNTC1P50748 2209 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRF-216ENST00000617451 URB1O60287 2271 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
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PTPRF-216ENST00000617451 KRT5P13647 590 aa25.76■■□□□ 1.71
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PTPRF-216ENST00000617451 CAMK2BQ13554 666 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 COL28A1Q2UY09 1125 aa25.76■■□□□ 1.71
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PTPRF-216ENST00000617451 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
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PTPRF-216ENST00000617451 TJP2Q9UDY2 1190 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 FTSJ1Q9UET6 329 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 CYTH4Q9UIA0 394 aa25.76■■□□□ 1.71
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PTPRF-216ENST00000617451 GOT1P17174 413 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
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PTPRF-216ENST00000617451 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
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PTPRF-216ENST00000617451 CHSY1Q86X52 802 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 STK40Q8N2I9 435 aa25.75■■□□□ 1.71
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PTPRF-216ENST00000617451 FAM149AA5PLN7 773 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 E5RJQ4 531 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 MED7O43513 233 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 GNA14O95837 355 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 ADH1BP00325 375 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 C5AR1P21730 350 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 PSMD8P48556 350 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRF-216ENST00000617451 NUCB2P80303 420 aa25.74■■□□□ 1.71
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