RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1W2PQ27 194 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1W2PQ64 194 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ASLP04424 464 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PAEPP09466 180 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ITPKBP27987 946 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 CD38P28907 300 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SLC8A1P32418 973 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PSMD8P48556 350 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 NUMBP49757 651 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ARID5BQ14865 1188 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 OR2T34Q8NGX1 318 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ADAM32Q8TC27 787 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SAP25Q8TEE9 199 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SLC39A13Q96H72 371 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 FAM129BQ96TA1 746 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 MIS12Q9H081 205 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 FZD4Q9ULV1 537 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa13.45□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 LRRC72A6NJI9 287 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 E9PAM4 449 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 RFPL3O75679 317 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PRB1P04280 392 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ITGAVP06756 1048 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ABCB4P21439 1286 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ABCG1P45844 678 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ACADVLP49748 655 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 METAP1P53582 386 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ADPRHP54922 357 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PPP2CBP62714 309 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PPP2CAP67775 309 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 CDH18Q13634 790 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 CNGA2Q16280 664 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 DCAF6Q58WW2 860 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TAC4Q86UU9 113 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 APCDD1Q8J025 514 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 STK40Q8N2I9 435 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 EID2Q8N6I1 236 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 KDM1BQ8NB78 822 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PTPRN2Q92932 1015 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 OMDQ99983 421 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TLR6Q9Y2C9 796 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.44□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 JUPP14923 745 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 VAV1P15498 845 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 DRD3P35462 400 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 FMO5P49326 533 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 CCR5P51681 352 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ECT2LQ008S8 904 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SEMG2Q02383 582 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 BNIP3Q12983 259 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 COBLL1Q53SF7 1204 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 HES3Q5TGS1 186 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SYPL2Q5VXT5 272 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 OR14C36Q8NHC7 312 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TSC1Q92574 1164 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 NXPE2Q96DL1 559 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SERAC1Q96JX3 654 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 HSFY1Q96LI6 401 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 SERPINB11Q96P15 392 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 NT5C1BQ96P26 610 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TSG101Q99816 390 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 GDF3Q9NR23 364 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 DACH1Q9UI36 760 aa13.43□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 LATO43561 262 aa13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 FBXO21O94952 628 aa13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 GOT1P17174 413 aa13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 HNF1BP35680 557 aa13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 NXPH1P58417 271 aa13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
FCHO1-220ENST00000597474 NNTQ13423 1086 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms