RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592759.5

POP4-213, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 4

Gene POP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-213	ENST00000592759	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		12.91	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		12.91	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		12.91	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		12.91	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759		A0A1B0GVM2	712 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	PRR33	A8MZF0	331 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	PRPSAP2	O60256	369 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	SRGAP2	O75044	1071 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	APOD	P05090	189 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	DRD1	P21728	446 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	CHST9	Q7L1S5	443 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	FAM71B	Q8TC56	605 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	TSC1	Q92574	1164 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	ZWILCH	Q9H900	591 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		12.9	□□□□□ -0.34
POP4-213	ENST00000592759	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	BUB1	O43683	1085 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	IL4R	P24394	825 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	TNFRSF4	P43489	277 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	CDH4	P55283	916 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	KRT83	P78385	493 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	DPYSL2	Q16555	572 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	FUT11	Q495W5	492 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	BOLA3	Q53S33	107 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	LRRC31	Q6UY01	552 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	MFN1	Q8IWA4	741 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	APCDD1	Q8J025	514 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	USP33	Q8TEY7	942 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	KLC2	Q9H0B6	622 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	CHRD	Q9H2X0	955 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	ALG6	Q9Y672	507 aa		12.89	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	CACNA1H	O95180	2353 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	STK25	O00506	426 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	RNF40	O75150	1001 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	CLDN11	O75508	207 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	CD48	P09326	243 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	RHOQ	P17081	205 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	GOT1	P17174	413 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	COMT	P21964	271 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	AVPR2	P30518	371 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	CSK	P41240	450 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	PLK1	P53350	603 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	SEC13	P55735	322 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	KIAA1328	Q86T90	577 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	TTC17	Q96AE7	1141 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	ACOX2	Q99424	681 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	PSMB7	Q99436	277 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		12.88	□□□□□ -0.35
POP4-213	ENST00000592759	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		12.88	□□□□□ -0.35

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